数据集概述
本数据集为Mitchell's satyr蝴蝶（Neonympha mitchellii mitchellii）的保护遗传学研究数据，包含48个个体（来自5个种群）的6种分子标记（5个核基因、1个线粒体基因）相关文件，支持系统发育、聚类及溯祖分析，用于明确亚种分类关系及保护策略制定，共23个文件。
文件详解
- 分子标记数据文件（.nex格式）
- 文件名称：GAPDH_sort.nex、AL21_sort.nex、EF1a_sort.nex、RpS5_sort.nex等共7个
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：每个文件对应一个基因位点，包含48个个体的序列数据，个体顺序统一，用于系统发育分析（如MrBayes）
- 分析参数文件（.csv格式）
- 文件名称：MSB_IM_11m.csv、IM_10j.csv等共6个
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含溯祖分析（IM模型）的参数数据，如t0（分化时间）、P（种群大小）、u（突变率）、Ka（迁移率）等
- 代码文件（.R格式）
- 文件名称：MSB_Sanger_plots.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于生成Sanger测序结果可视化图表的代码文件
- 分析代码说明文件（.txt格式）
- 文件名称：Analysis_code.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录重现Hamm et al. 2013年《Journal of Heredity》论文分析的代码说明，包含6个基因位点的.nex文件使用说明
- 其他数据文件
- 文件名称：MSB_IM_9h.xlsx、MSB_IM_14.txt等
- 文件格式：XLSX、TXT等
- 字段映射介绍：包含补充数据及中间分析结果
数据来源
论文“Conservation genetics and the implication for recovery of the endangered Mitchell's satyr butterfly, Neonympha mitchellii mitchellii”（Hamm et al. 2013）
适用场景
- 濒危蝴蝶亚种分类研究: 利用分子标记数据明确Mitchell's satyr蝴蝶亚种的系统发育关系
- 保护遗传学分析: 通过聚类及溯祖分析评估种群遗传结构，为濒危物种保护策略提供依据
- 分子标记数据应用: 为昆虫遗传学研究提供标准化的基因位点序列数据参考
- 溯祖模型参数验证: 基于.csv文件中的参数数据，验证IM模型在濒危物种分化研究中的适用性
- 测序数据可视化: 使用R代码文件复现Sanger测序结果的可视化分析
