数据集概述
本数据集围绕向日葵沙丘生态型的非杂交起源研究,包含基于限制性相关DNA(RAD)序列的基因组数据,用于分析沙丘生态型的起源时间、基因流模式及适应性进化机制。数据覆盖20个沙丘生态型与20个非沙丘生态型样本,支持对生态物种形成和并行进化的基因组学研究。
文件详解
- 说明文档(README文件)
- 文件名称:README_for_gsd75_sample100_3.txt、README_for_gsd_rad_structure_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录IMa2分析的样本信息(100个75bp RAD序列位点、40个样本)、分析命令示例(如Burnin运行命令)及数据处理说明。
- 序列数据文件
- 文件名称:gsd75_sample100_3.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Great Sand Dunes 75bp RAD序列数据,记录100个可接受位点的样本信息(沙丘/非沙丘分类、样本编号、序列特征等)。
- SNP数据文件
- 文件名称:GSD_RAD_SNPs.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:存储RAD衍生的单核苷酸多态性(SNP)数据,用于分析沙丘与非沙丘生态型的遗传分化。
- 结构数据压缩包
- 文件名称:gsd_rad_structure_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含RAD结构数据分析相关文件,具体内容需解压查看。
数据来源
论文“Recent non-hybrid origin of sunflower ecotypes in a novel habitat”
适用场景
- 植物适应性进化研究: 分析向日葵沙丘生态型的起源时间、基因流模式及非杂交适应性机制。
- 基因组学与生态物种形成: 探究基因流和种群大小对并行进化路径及适应性基因组特征的影响。
- 遗传分化分析: 利用SNP数据识别沙丘与非沙丘生态型的遗传差异位点,解析适应性进化的遗传基础。
- 种群遗传学模型验证: 基于IMa2分析框架,验证隔离迁移模型在植物生态型研究中的应用。