GSD_Source_向日葵沙丘生态型非杂交起源基因组数据

数据集概述

本数据集围绕向日葵沙丘生态型的非杂交起源研究,包含基于限制性相关DNA(RAD)序列的基因组数据,用于分析沙丘生态型的起源时间、基因流模式及适应性进化机制。数据覆盖20个沙丘生态型与20个非沙丘生态型样本,支持对生态物种形成和并行进化的基因组学研究。

文件详解

  • 说明文档(README文件)
  • 文件名称:README_for_gsd75_sample100_3.txt、README_for_gsd_rad_structure_data.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:记录IMa2分析的样本信息(100个75bp RAD序列位点、40个样本)、分析命令示例(如Burnin运行命令)及数据处理说明。
  • 序列数据文件
  • 文件名称:gsd75_sample100_3.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含Great Sand Dunes 75bp RAD序列数据,记录100个可接受位点的样本信息(沙丘/非沙丘分类、样本编号、序列特征等)。
  • SNP数据文件
  • 文件名称:GSD_RAD_SNPs.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:存储RAD衍生的单核苷酸多态性(SNP)数据,用于分析沙丘与非沙丘生态型的遗传分化。
  • 结构数据压缩包
  • 文件名称:gsd_rad_structure_data.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含RAD结构数据分析相关文件,具体内容需解压查看。

数据来源

论文“Recent non-hybrid origin of sunflower ecotypes in a novel habitat”

适用场景

  • 植物适应性进化研究: 分析向日葵沙丘生态型的起源时间、基因流模式及非杂交适应性机制。
  • 基因组学与生态物种形成: 探究基因流和种群大小对并行进化路径及适应性基因组特征的影响。
  • 遗传分化分析: 利用SNP数据识别沙丘与非沙丘生态型的遗传差异位点,解析适应性进化的遗传基础。
  • 种群遗传学模型验证: 基于IMa2分析框架,验证隔离迁移模型在植物生态型研究中的应用。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.03 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。