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组蛋白变体H2A_Z转录调控的结构机制支持性数据集
数据集概述 本数据集是关于组蛋白变体H2A.Z转录调控结构机制研究的支持性数据，包含分子坐标、冷冻电镜图谱及验证报告等文件，为相关研究论文评审提供数据支撑。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： - 分子坐标文件: - 7M1X.pdb: PDB格式文件，存储H2A.Z核小体的分子坐标数据。 - 冷冻电镜图谱文件（.mrc格式）: -...
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百日咳腺苷酸环化酶毒素缺失突变体proRTX719的SAXS数据集
数据集概述 本数据集包含百日咳腺苷酸环化酶毒素缺失突变体proRTX719的小角X射线散射（SAXS）实验数据，涵盖原始测量数据、处理后帧数据、尺寸排阻色谱（SEC）数据、紫外吸收数据及色谱图，为研究该突变体的结构特性提供支持。 文件详解 raw.tar.gz：压缩文件，包含SAXSpoint 2.0仪器记录的原始SAXS数据...
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组蛋白脱乙酰酶6抑制剂结合相关蛋白质结构域运动数据集
数据集概述 该数据集包含组蛋白脱乙酰酶6（HDAC6）作为受体，贝利司他（belinostat）和HPOB作为配体的分子对接研究相关文件，支持DockIT软件的自动化交互对接实验，可复现研究结果。 文件详解 文件名称: Iakovou_et_al_JCAMD_Data.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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氟代亮氨酸生产GB1的NMR光谱及野生型参考光谱数据集
数据集概述 本数据集包含使用氟代亮氨酸生产的GB1蛋白核磁共振（NMR）光谱数据，以及野生型GB1的参考光谱数据，共6个压缩文件，用于支持相关研究成果发表。 文件详解 压缩文件集合（共6个.zip格式文件）： FLeu2.zip：氟代亮氨酸条件下的GB1 NMR光谱数据压缩包 FLeu1.zip：氟代亮氨酸条件下的GB1 NMR光谱数据压缩包...
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FireProtDB与PDB结构蛋白质稳定性数据集
数据集概述 本数据集整合FireProtDB的序列突变热力学稳定性数据（ddG）与RCSB PDB的蛋白质结构文件，用于训练预测蛋白质点突变稳定性变化的模型。包含3438个突变数据及对应结构，支持蛋白质工程与结构生物学研究。 文件详解 压缩包文件： fireprot_upload.zip：压缩包格式，包含数据集所有内容 目录与子文件：...
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人类赖氨酸脱甲基酶JMJD2D_KDM4D_靶点支持包
数据集概述 该数据集是关于人类赖氨酸脱甲基酶JMJD2D(KDM4D)的靶点支持包，包含SGC Oxford在探针项目中针对JMJD2家族成员开展的表达、纯化、结晶及片段筛选等研究信息，因未获得具有探针性质的分子，相关信息被公开。 文件详解 文件名称: JMJD2D_TEP_datasheet_v5.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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AP2与网格蛋白_PtdIns_4_5_P2富集膜相互作用研究的原始张力测量_剪切流变学和中子反射数据
数据集概述 本数据集包含界面张力测量、剪切流变学和中子反射测量的原始实验数据，针对仿生膜的界面性质、粘弹性行为及蛋白质在界面的结构组织展开，研究AP2蛋白结合相关过程，数据格式以压缩包为主。 文件详解...
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疟疾寄生虫侵袭阶段相关脂质转移蛋白研究辅助文件集
数据集概述 本数据集为"桥梁样脂质转移蛋白对疟疾寄生虫侵袭阶段生成至关重要"预印本的辅助文件集，包含AlphaFold3预测的蛋白质结构、转染质粒序列及FFAT基序识别Python代码，支持相关研究的复现与扩展。 文件详解 结构文件（.zip格式）：...
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经典半乳糖血症药物发现靶点赋能包_GALT_GALK1
数据集概述 本数据集是针对经典半乳糖血症（一种罕见的半乳糖代谢紊乱疾病，目前缺乏疾病转化疗法）的药物发现计划靶点赋能包（TEP）。包含蛋白质试剂、生物物理分析方法及结构信息，支持理解GALT酶缺陷的分子机制，以及探索通过干预上游GALK1酶（底物减少策略）缓解GALT缺陷的化学起点。 文件详解 文件名称:...
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USP_Zf_UBD蛋白多序列比对数据集
数据集概述 该数据集包含使用Molsoft的ICM-Pro软件对USP Zf-UBD蛋白与HDAC6 Zf-UBD蛋白进行多序列比对的结果，由比对数据文件和说明文档组成，为蛋白质序列分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：USP Zf-UBD multiple sequence...
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HDXRank深度学习框架蛋白质复合物预测排序数据集
数据集概述 本数据集包含用于训练HDXRank模型的氢氘交换质谱（HDX-MS）数据，该模型可基于实验HDX数据对蛋白质复合物预测结果进行排序。数据源自公共数据库，为蛋白质复合物预测的深度学习研究提供支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: example.zip - 文件格式: ZIP (.zip) - 内容说明:...
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线虫透明带模块分子进化分析数据集
数据集概述 本数据集围绕线虫透明带（ZP）模块的分子进化展开，通过系统发育与结构分析，揭示二硫键重组及独立ZP-C结构域的存在，为理解ZP模块多样性、进化机制及功能提供数据支持。 文件详解 该数据集包含7个独立文件，具体说明如下： - 文档文件: - Dryad_-README(1).pdf:...
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HTT79_3144蛋白有无HAP40结合的Sf9昆虫细胞表达与纯化数据集20190128
数据集概述 本数据集记录了2019年1月28日完成的HTT79-3144蛋白（缺失外显子1非结构化区域）在Sf9昆虫细胞中有无HAP40结合的表达与纯化实验，为研究HTT蛋白外显子1依赖性功能提供对照数据。 文件详解 文件名称: Expression and purification of HTT79-3144 with and without...
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病毒衣壳粒模型_表面结构3
数据集概述 该数据集为病毒学教育用模型，基于甲型肝炎病毒蛋白质结构（RCSB PDB:4QPG）设计，通过五棱锥投影实现精确表面可视化，包含T=3及伪3型病毒结构模型（装配单元07/08）。 文件详解 文件名称：thumb0.jpeg、thumb1.jpeg、thumb2.jpeg、thumb3.jpeg、thumb4.jpeg...
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DSR代谢相关蛋白质复合物AlphaFold_3预测结构数据集
数据集概述 本数据集包含通过AlphaFold 3服务器预测的DsrMKJOP、DsrMK和NarGHI三种蛋白质复合物的结构模型，每种预测生成5个结构，附带有对应置信度指标，用于支撑DSR代谢中三硫化物还原与能量守恒的结构基础研究。 文件详解 压缩文件包（共10个，均为.zip格式）：...
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正交晶型溶菌酶晶体MicroED数据2016_2017
数据集概述 本数据集包含2016-2017年收集的正交晶型溶菌酶晶体的MicroED原始数据，数据支撑Xu等人2018年发表于《Structure》期刊的研究，为蛋白质晶体结构分析提供原始实验数据。 文件详解 文件名称：ReadME.pdf，文件格式：PDF，内容为数据集说明文档，包含数据背景、使用方法等信息...
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USP5锌指泛素结合域结构分析
数据集概述 本数据集聚焦USP5锌指泛素结合域（Zf-UBD）的结构分析，包含在特定结晶条件下对其结构的解析结果，旨在探究泛素结合口袋是否可通过溶剂通道接触，为抑制剂筛选提供依据。 文件详解 文件名称：20180329_Structural Analysis of USP5 Zf-UBD.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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SARS_CoV_2全基因组结构与功能建模数据集
数据集概述 本数据集提供了针对SARS-CoV-2基因组中所有蛋白质的同源模型及功能注释信息，涵盖蛋白质结构模型、序列数据和多序列比对文件，为研究新冠病毒蛋白质的结构特征与功能机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: models (1).zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 包含SARS-CoV-2蛋白质的同源模型数据 文件名称: seq...
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碳水化合物_蛋白质复合物结构库
数据集概述 该数据集为碳水化合物-蛋白质复合物结构库，包含阳性和阴性两类样本结构。阳性样本来自PDB数据库经冗余清理与Rosetta优化的解析结构，阴性样本为Rosetta生成的人工劣质碳水化合物结合蛋白，涉及多种碳水化合物类型。 文件详解 文件名称: CPL_PDBID.txt，文件格式: TXT 字段映射: 包含file_name（文件名）、PDB...
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基于图的深度学习模型预测蛋白质可电离残基pKa值数据集
数据集概述 该数据集包含用于复现“基于图的深度学习模型预测蛋白质可电离残基pKa值”研究结果的代码与数据，核心围绕物理启发特征工程构建的预测模型相关资料展开。 文件详解 文件名称：Graph_pKa.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含复现研究结果所需的全部代码与数据，无具体文件拆分信息（未提供README或内容预览） 适用场景...
