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狐蝠科线粒体基因组基因特异性替代率数据_2025年
数据集概述 本数据集包含蝙蝠科（Vespertilionidae）线粒体基因组的基因特异性替换率数据，以及三个新线粒体基因组的描述信息。数据涵盖基因注释、序列比对、系统发育树及BEAST分析结果，支持蝙蝠线粒体基因组进化研究，共含10个文件。 文件详解 注释数据文件 文件名称：annotation_data.xlsx 文件格式：XLSX...
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iwc_Purgedups_VGP6工作流测试数据
数据集概述 本数据集为iwc工作流的测试数据，包含Purgedups VGP6相关的基因组组装及分析文件，涵盖预估基因组大小参数、Hifiasm组装结果、Meryl数据库、Genomescope模型参数和Pacbio测序数据等，共6个文件，用于生物信息学工作流的测试验证。 文件详解 预估基因组大小参数文件 文件名称：Estimated genome...
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活跃的稀有生物圈证据_淡水原生生物群落活性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦淡水原生生物群落中的活性稀有生物圈，通过焦磷酸测序分析RNA和DNA水平的多样性，揭示稀有原生生物的丰富度、组成及活性特征，为理解湖泊生态系统功能提供数据支持，包含4个核心文件。 文件详解 synthese_OTU_RNA_DNA.csv 文件格式：CSV...
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OGRDB_Source_小鼠IGLJ种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠IG受体种系参考集，包含小鼠所有品系的IGLJ种系数据，涵盖带间隙、无间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可说明文件，共4个文件，用于生物医学领域的免疫受体研究。 文件详解 文件名称：Mouse_IGLJ (all...
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Daphnia_longispina基因结构研究数据
数据集概述 本数据集记录比利牛斯山高山湖泊浮游甲壳动物Daphnia longispina的基因结构，用于研究末次冰盛期后建立者效应与扩散迁移对基因多样性的影响。数据显示该物种基因结构由单一殖民事件塑造，核基因多样性从东南向西北递减，线粒体突变率高于常规假设，为小尺度长期建立者效应研究提供支持。 文件详解 文件名称：Ventura-Microsats-...
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Pongo_Based古生物多样性系统发育树构建数据
数据集概述 本数据集为论文“Geometric morphometrics and paleoproteomics in tandem enlighten the paleodiversity of Pongo”的系统发育树构建所用数据，包含古蛋白质序列、参考数据集及序列比对结果，支持对猩猩（Pongo）古生物多样性的研究，总计含多个文件及子文件夹。...
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C_elegans_RNA_线虫病毒发现测序原始数据
数据集概述 本数据集包含两种线虫（C. elegans JU1580和C. briggsae JU1264）的RNA测序数据，通过Roche Titanium基因组测序仪获得。数据经质量和重复序列过滤后，从中发现了两种新的诺达病毒科成员，分别为Orsay诺达病毒和Santeuil诺达病毒，对应测序读段数量分别为1046条和2492条。 文件详解...
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Arena_Based_RNA结构重建基准测试数据集
数据集概述 本数据集包含Arena程序相关的基准测试数据，用于评估RNA结构重建程序的性能。数据集分为五个压缩文件，涵盖Arena源代码、基准测试用数据集、RNA核苷酸序列、PDB ID列表及RNA分类文件，为RNA结构重建研究提供标准化测试资源。 文件详解 Arena-main.zip 文件格式：ZIP...
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沃尔巴克氏菌线粒体DNA变异体与宿主种群入侵监测数据
数据集概述 本数据集包含Wolbachia入侵宿主种群动态监测相关的线粒体DNA（mtDNA）变异数据，涵盖蚊虫样本的核苷酸序列、样本详情、RADseq位点信息及分析脚本等，用于研究Wolbachia释放后在宿主种群中的传播规律及相关影响因素，共包含9个文件。 文件详解 核苷酸序列文件（共6个） 文件名称：Nucleotide...
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FLYTREE_Based蝇类生命树演化辐射研究数据
数据集概述 本数据集为蝇类生命树演化辐射研究的系统发育基因组学数据，包含149个蝇科的分子（核基因、线粒体基因组）与形态学数据，用于揭示蝇类三次快速辐射事件及食性转变历史，支持昆虫演化、基因组比较等研究，共36份文件。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式）...
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GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据
数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序（GBS）策略优化研究的数据，包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果，涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化，以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试，为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称：9pt-...
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物种分化基因组学研究数据_墨西哥鸭与绿头鸭的比较分析
数据集概述 本数据集为墨西哥鸭与绿头鸭早期分化阶段的物种形成基因组学研究数据，包含线粒体DNA控制区、3523个常染色体位点及172个Z连锁性染色体位点的遗传多样性与分化模式数据，用于探究物种分化机制及Z染色体在其中的作用。 文件详解 BAYESCAN.FILES.zip 文件格式：ZIP...
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CREMSA_Based多序列比对压缩索引论文支持数据
数据集概述 本数据集为论文“CREMSA: Compressed Indexing of (Ultra) Large Multiple Sequence...
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Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据
数据集概述 本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件，涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型，共七个文件，用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式） 文件名称：trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta...
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POA_转录组_鸟类巢寄生母性照料缺失分子机制研究数据
数据集概述 本数据集通过比较两种巢寄生鸟类与一种近缘非寄生拟鹂科（黑鹂）鸟类的脑基因表达模式，探究巢寄生行为的分子与神经生物学机制。重点分析调控亲代行为的关键脑区——视前区（POA）的转录组差异，识别与巢寄生相关的基因表达模式，验证幼态延续、母性照料基因下调、母性抑制基因上调三种进化假说，为巢寄生母性行为缺失的转录组机制提供首个研究证据。 文件详解...
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选择性性别偏好分散行为_圆顶鲨鱼_适应性变异_研究数据
数据集概述 本数据集为双髻鲨（Sphyrna tiburo）性别偏向扩散与选择研究的相关数据，包含样本信息、遗传序列、处理脚本等11个文件。核心内容涉及该鲨鱼核基因SNP及线粒体控制区序列变异分析，用于探究雌性恋家行为对适应性变异的影响，支持海洋生物遗传结构与扩散机制研究。 文件详解 样本与处理脚本类...
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密西西比河流域亚洲鲤鱼杂交种的单核苷酸多态性基因型分析
数据集概述 本数据集记录密西西比河流域引入种鳙鱼（Hypophthalmichthys nobilis）与鲢鱼（H. molitrix）的基因渐渗杂交情况，包含2798尾个体的57个核基因SNP和1个线粒体SNP（COII）基因型数据，以及部分个体的母系遗传分析结果，用于揭示入侵种间杂交的空间分布、世代结构及母系偏向性特征。 文件详解...
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Ambystoma_蝾螈姐妹种核质基因进化基础研究数据
数据集概述 本数据集围绕蝾螈姐妹种（Ambystoma barbouri和A. texanum）的核质基因不一致现象展开，包含核DNA与线粒体DNA数据，通过多种方法分析其进化过程，探究线粒体DNA渐渗的方向、时间尺度及环境选择作用，为动物基因分化研究提供实例。 文件详解 序列文件包 文件名称：Denton_fasta files for...
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BQH_Based_微生物适应性基因丢失与依赖进化数据
数据集概述 本数据集为论文《The Black Queen Hypothesis: evolution of dependencies through adaptive gene...
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NTM_Based_非结核分枝杆菌物种特异性蛋白肽数据
数据集概述 本数据集包含通过深度蛋白质组学分析鉴定的非结核分枝杆菌（NTM）物种特异性蛋白肽。研究覆盖9种NTM，分析26个数据集，获得2000万肽谱匹配，实现7种NTM的≥40%蛋白质组覆盖，并筛选出M. smegmatis等5种NTM的高置信度物种特异性肽，同时提供光谱库格式数据支持靶向蛋白质组学工作流。 文件详解 TXT文件（共9个）...
