数据集概述
本数据集为双髻鲨（Sphyrna tiburo）性别偏向扩散与选择研究的相关数据，包含样本信息、遗传序列、处理脚本等11个文件。核心内容涉及该鲨鱼核基因SNP及线粒体控制区序列变异分析，用于探究雌性恋家行为对适应性变异的影响，支持海洋生物遗传结构与扩散机制研究。
文件详解
- 样本与处理脚本类
- 文件名称：
SampleCollectionInfo.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：推测包含双髻鲨样本采集的基本信息，如样本编号、采集地点、性别等
- 文件名称：
Filter_Script.sh、FB_filters_Bhead.sh、pop_map.shark
- 文件格式：SH
- 字段映射介绍：数据处理脚本，用于遗传数据的过滤与群体映射
- 遗传数据类
- 文件名称：
SNP.FINAL.recode.vcf、TotalRawVariants.vcf.gz
- 文件格式：VCF、VCF.GZ
- 字段映射介绍：包含双髻鲨核基因单核苷酸多态性（SNP）的原始与处理后数据
- 文件名称：
OutlierHaps.gen、NeutralHaps.gen
- 文件格式：GEN
- 字段映射介绍：异常位点与中性位点的单倍型数据
- 文件名称：
HaplistNov21.hap、reference.fasta
- 文件格式：HAP、FASTA
- 字段映射介绍：单倍型列表与参考基因组序列
- 其他文件
- 文件名称：
visualist、no_ext文件
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：推测为数据可视化或辅助分析文件
数据来源
论文“Selection and sex-biased dispersal in a coastal shark: the influence of philopatry on adaptive variation”
适用场景
- 海洋生物遗传结构研究: 利用SNP与线粒体序列数据，分析双髻鲨种群遗传多样性与结构
- 性别偏向扩散机制分析: 通过遗传变异模式，探究该鲨鱼性别相关的扩散行为对基因流的影响
- 适应性变异影响因素研究: 结合恋家行为数据，研究其对双髻鲨适应性遗传变异的作用
- 海洋生物保护策略制定: 基于种群遗传数据，为双髻鲨保护提供科学依据
- 遗传数据分析方法验证: 利用脚本文件复现遗传数据处理流程，验证分析方法的可靠性
