找到63个数据集

标签: SNP

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  • Triturus_Newt_Genetic_Data_塞尔维亚东部蝾螈遗传分析数据集

    2026年1月18日 30 194 189

    数据集概述 本数据集包含对塞尔维亚东部Vrtovać地区9个Triturus蝾螈样本(含T. arntzeni模式标本及副模式标本)的核基因数据,通过二代测序获取52个标记。数据与当地4种冠螈参考序列对比,分析样本遗传成分,为物种分类提供依据。 文件详解 原始数据文件 文件名称:1 - FASTQ_IonTorrent.zip...
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  • Plasmodium_falciparum_New_World殖民化_抗原选择模式研究数据

    2026年1月17日 30 186 2

    数据集概述 本数据集围绕恶性疟原虫在新大陆殖民后红细胞结合抗原(eba基因)的选择模式展开,包含3个eba基因、2个管家基因的序列数据及272个SNP数据集、补充表格,共7个文件。通过对比南美与非洲种群的基因多态性,分析eba基因在新宿主环境下的选择压力差异,为疟原虫进化研究提供基础数据。 文件详解 基因序列文件(.fas格式,共5个)...
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  • Inbreeding_Genomics_Based个体近交系数测量方法比较研究数据2015

    2026年1月17日 30 124 9

    数据集概述 本数据集围绕基因组学时代个体近交系数测量展开,通过计算机模拟比较系谱近交系数(FP)与基因组标记法(FH、FROH、FE)对实际基因组同源性(IBDG)的预测效果,验证了基因组标记法在大样本SNP下的优越性,为生态学、进化和保护生物学领域提供方法参考。 文件详解 文档文件...
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  • RAD_seq_MassARRAY_北美东部橡树核DNA条形码及植物园杂交研究数据

    2026年1月15日 30 206 187

    数据集概述 本数据集为北美东部8种常见白橡树核DNA条形码研究及植物园杂交分析相关数据。研究通过RAD-seq技术开发含80个SNP的条形码工具包,结合MassARRAY技术验证,分析Morton Arboretum中移栽橡树与本地树种的杂交情况。包含5个文件,涉及SNP提取脚本、不同筛选阶段的SNP矩阵及基因座序列压缩包。 文件详解...
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  • 酿酒酵母CBS_493_94基于全基因组测序的单核苷酸多态性_SNP_距离矩阵数据

    2026年1月14日 30 5 3

    数据集概述 本数据集为酿酒酵母CBS 493.94菌株的全基因组测序相关数据,核心内容是SNP(单核苷酸多态性)距离矩阵,以单个Excel文件形式存储,可用于分析该菌株基因组的遗传变异特征。 文件详解 文件名称:Annex 1_ CBS493.94_SNP distance matrix.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含酿酒酵母CBS...
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  • 刺盖鱼_Gasterosteus_aculeatus_耐盐性变异的遗传基础研究数据

    2026年1月14日 30 84 7

    数据集概述 本数据集围绕三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)溯河型与溪流型生态型的盐度耐受性遗传机制展开,通过整合基因组学方法识别盐度适应相关候选基因。包含海水胁迫下血浆钠浓度的数量性状位点(QTL)定位、鳃组织基因表达分析、全基因组测序及基因组扫描结果,涉及ATP合成、激素信号等通路基因,为解析盐度适应的遗传基础提供数据支撑。...
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  • Notochthamalus_SNP_Based_智利海岸藤壶种群遗传学研究补充数据

    2026年1月14日 30 17 9

    数据集概述 本数据集是智利海岸藤壶Notochthamalus scabrosus种群遗传学研究的补充数据,包含130个单核苷酸多态性(SNP)的核基因多态性数据,用于分析线粒体谱系与核基因组信号的一致性,揭示该物种沿智利海岸生物地理分布模式的形成机制。 文件详解 文件名称:Supplement S2 SNP Data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • North_Pacific_Based_港湾鼠海豚SNP微单倍型线粒体控制区单倍型数据

    2026年1月14日 30 46 20

    数据集概述 本数据集包含北太平洋港湾鼠海豚的SNP、微单倍型基因型及线粒体控制区单倍型序列数据,覆盖加州至不列颠哥伦比亚南部沿岸及内陆水域样本。通过292个位点的多重扩增子测序(271个样本)和mtDNA序列(413个样本),揭示种群遗传结构、隔离距离模式及潜在适应性,为该近岸物种保护管理提供依据。 文件详解...
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  • ECE_2015_10_00703_Source_哈德逊湾北极熊种群结构SNP评估数据

    2026年1月14日 30 24 2

    数据集概述 本数据集包含基于单核苷酸多态性(SNPs)的哈德逊湾地区北极熊种群结构评估数据,涉及414个个体的2603个SNP基因型信息。研究通过DAPC和STRUCTURE分析支持四个遗传集群的存在,与现有微卫星研究及管理划分存在差异,可用于精细种群结构研究。 文件详解 文件1:README_for_ECE-2015-10-00703.docx...
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  • Kinship_Simulation_分子与谱系亲属关系对应性研究数据_Archive

    2026年1月14日 30 76 15

    数据集概述 本数据集围绕分子与谱系亲属关系对应性展开研究,通过个体模型模拟不同种群特征、遗传标记类型及数量等因素对亲属关系分类率(RCA)的影响,包含11个核心研究问题的模拟结果,为生态与保护遗传学领域的亲属关系分析提供方法参考。 文件详解 主文件:RCAsimulation.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • Dryad_Eucalyptus_microcarpa_气候基因组适应研究数据2017

    2026年1月14日 30 88 30

    数据集概述 本数据集基于DArTseq基因组方法,对澳大利亚东南部26个细叶桉种群的4200余个全基因组单核苷酸多态性(SNPs)进行分析,识别出81个与温度、干旱或降水相关的适应性SNPs,涉及所有11条染色体,为研究气候变化下物种适应性潜力提供支撑。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Arabidopsis_Capsella_Based_拟南芥与荠菜开花时间变异研究数据

    2026年1月13日 30 147 62

    数据集概述 本数据集记录了拟南芥(Arabidopsis thaliana)和荠菜(Capsella rubella)自然种群中开花时间变异的遗传学研究数据,重点关注FLOWERING LOCUS C(FLC)基因的突变影响,包含20份荠菜材料在不同条件下的开花时间观测及基因变异分析结果,共涉及4个文件。 文件详解 README文件...
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  • Zosterops_borbonicus_based留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性进化数据

    2026年1月13日 30 137 82

    数据集概述 本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据,包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据,用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。 文件详解 文件名称:Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Compositae_Crops_Based向日葵及菊科作物驯化改良有害突变积累研究数据

    2026年1月13日 30 157 122

    数据集概述 本数据集基于全转录组单核苷酸多态性数据,对比分析21份向日葵自然种群与19份驯化种群的有害突变负荷,同时扩展研究菊科其他驯化物种( globe artichoke、cardoon)的同类模式,揭示驯化改良过程中有害突变积累规律及低重组区域的选择效率差异,共包含6个相关文件。 文件详解 文件名称:snp_table_all3(无扩展名)...
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  • Strawberry_Based_草莓挥发性有机物代谢组数据与QTL研究补充数据_2025版

    2026年1月12日 30 141 66

    数据集概述 本数据集为论文“Multivariate QTL approach reveals a major regulator of terpenoid production and other volatiles in...
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  • SNP_Adaptive_Mutation_杂草稻群体新单核苷酸多态性与耕作方式关联研究数据

    2026年1月12日 30 52 10

    数据集概述 本数据集围绕杂草稻群体的新单核苷酸多态性(SNP)展开,通过全基因组比较和PCR指纹分析,探究不同稻作区杂草稻群体新SNP频率与耕作方式变化的关联,以揭示人类活动影响下杂草稻适应性突变与快速进化的机制,包含1份文档文件。 文件详解 文件名称:Table S1.docx 文件格式:DOCX...
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  • Mendelian_Randomization_Based_帕金森病与风险行为因果关联研究数据

    2026年1月12日 30 94 68

    数据集概述 本数据集为一项关于风险行为与帕金森病因果关联的孟德尔随机化研究数据,通过两样本孟德尔随机化方法,利用全基因组关联研究汇总统计数据,分析吸烟倾向、汽车速度倾向、性伴侣数量等风险行为与帕金森病的关联,包含补充表格和方法文档两类文件。 文件详解...
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  • Pseudophryne_coriacea_Based_红背蟾蜍雌性配偶选择与遗传质量研究数据

    2026年1月12日 30 111 5

    数据集概述 本数据集围绕野生红背蟾蜍(Pseudophryne coriacea)雌性配偶选择与雄性遗传质量的关系展开,通过全种群采样和单核苷酸多态性(SNPs)分析,检验“异质性优良基因”和“遗传兼容性”假说,发现雌性更倾向选择遗传相似的雄性,为遗传兼容性假说提供支持,共包含2个文件。 文件详解...
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  • Kentish_plover_Transcriptome_神经转录组组装及表达分析数据2013

    2026年1月11日 30 1 0

    数据集概述 本数据集为Kentish plover(Charadrius alexandrinus)的从头神经转录组组装结果,基于端脑和间脑组织的Illumina RNA-Seq短读长数据生成。包含超21000条表达转录本、31000余个高质量SNP、2500余个SSR,以及雌雄行为相关差异表达基因,为无参考基因组的生态模型物种提供转录组资源。...
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  • Arabidopsis_thaliana_Based拟南芥F2群体重组图谱与等位基因频率研究数据

    2026年1月9日 30 50 3

    数据集概述 本数据集围绕拟南芥F2群体减数分裂重组展开研究,包含17个F2群体(来自18个拟南芥品系杂交)的7000余株植物的等位基因频率、交叉位置及频率数据,揭示重组对杂交后代等位基因分离的影响,以及分离畸变的潜在原因和重组频率的分布规律。 文件详解 数据文件(.xls格式,共7个) 文件名称:discriminating SNPs.xls...
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