RAD_seq_Based_海扇贝遗传多样性与种群结构研究数据

数据集概述

本数据集基于RAD-seq技术对北美东部12个地点的245只海扇贝(Placopecten magellanicus)进行分析,包含7163个单核苷酸多态性位点(SNPs)数据,其中112个为潜在受选择的异常位点。数据揭示了海扇贝种群的南北遗传分化、等位基因频率的纬度梯度及有限的扩散能力,为渔业资源管理提供科学依据。

文件详解

  • VanWyngaardenM_etal_PopStructure_GeogDist.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含海扇贝种群地理分布相关数据,可能涉及采样地点的地理位置、种群遗传分化指数、扩散距离估算等信息
  • VanWyngaardenM_etal_PopStructure_SNPMap4b.vcf
  • 文件格式:VCF
  • 字段映射介绍:包含7163个SNPs的基因型数据,记录每个样本在各位点的等位基因信息,可用于种群结构分析、选择压力检测等遗传研究

数据来源

论文“Identifying patterns of dispersal, connectivity, and selection in the sea scallop, Placopecten magellanicus, using RAD-seq derived SNPs”

适用场景

  • 海洋渔业资源管理: 基于种群遗传结构分析结果,优化海扇贝渔业的管理单元划分与保护策略
  • 种群遗传学研究: 利用SNPs数据探究海扇贝种群的遗传多样性、基因流及种群分化机制
  • 选择压力分析: 通过异常位点数据识别海扇贝适应环境的关键基因,研究物种对环境变化的响应
  • 海洋生物地理学研究: 结合地理分布数据,分析海扇贝种群扩散模式与地理屏障的关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.98 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。