找到34个数据集

标签: RADseq

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  • RADseq_植物标本双酶切测序协议评估数据

    2026年2月1日 30 117 67

    数据集概述 本数据集围绕植物标本基因组测序展开,评估了双酶切RADseq协议在腊叶标本与硅胶干燥标本中的适用性。覆盖Draba、Boechera、Solidago、Ilex四个属,包含实验结果、分析文件及附录文档,为植物分类研究提供基因组数据支持。 文件详解 文本文件(.txt)...
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  • LDna_Based_连锁不平衡网络分析数据_进化研究

    2026年2月7日 30 25 15

    数据集概述 本数据集为LDna(连锁不平衡网络分析)相关研究数据,包含按蚊和三刺鱼两个测试案例的基因组数据,以及模拟、代码等文件。旨在通过LD网络分析识别染色体倒位、局部适应等进化现象,适用于非模式物种研究,共12个文件。 文件详解 按蚊RAD-seq数据文件...
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  • RADseq_Based聚类阈值优化实证流程配套数据

    2026年1月31日 30 49 24

    数据集概述 本数据集为论文“An empirical pipeline for choosing the optimal clustering threshold in RADseq studies”的配套数据,包含两个压缩文件,用于支持RADseq研究中聚类阈值优化实证流程的复现与分析,可辅助研究人员确定RADseq数据分析中的最优聚类参数。...
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  • RAD_seq_Based东亚葡萄物种网状进化研究数据

    2026年1月30日 30 123 113

    数据集概述 本数据集为探究东亚四种近缘葡萄物种(山葡萄、秋葡萄、陕西葡萄、毛葡萄)网状进化的RAD-seq测序数据,含46份覆盖形态与地理变异的样本,通过群体结构分析等揭示其复杂进化模式,支持同域种群间基因渐渗的存在,为东亚葡萄物种网状进化提供证据。 文件详解 文件名称:RAD_Vitis_filter_VCF.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • 马加迪湖罗非鱼的酒精耐受性与生态形态差异研究数据集_我是分割线

    2026年1月29日 30 178 90

    数据集概述 本数据集聚焦东非Magadi湖及Little Magadi湖极端环境(高温、高碱、高盐)中的Alcolapia属罗非鱼,通过RAD-seq基因组学、几何形态测量学、稳定同位素分析及种群动态模拟,探究其生态形态分化与适应性进化。数据覆盖种群基因组差异、形态特征、食性生态及种群历史,为研究小型鱼类辐射演化提供模型系统支撑。 文件详解...
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  • RAD_seq_Based_海扇贝遗传多样性与种群结构研究数据

    2026年1月29日 30 17 1

    数据集概述 本数据集基于RAD-seq技术对北美东部12个地点的245只海扇贝(Placopecten magellanicus)进行分析,包含7163个单核苷酸多态性位点(SNPs)数据,其中112个为潜在受选择的异常位点。数据揭示了海扇贝种群的南北遗传分化、等位基因频率的纬度梯度及有限的扩散能力,为渔业资源管理提供科学依据。 文件详解...
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  • DRYAD_Source_蒺藜苜蓿种群结构与共生基因选择分析数据

    2026年1月28日 30 133 75

    数据集概述 本数据集包含蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的种群基因组学分析数据,旨在揭示其种群遗传结构及共生相关基因的空间选择特征。通过RAD-...
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  • Jackson_ME_大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究存档数据

    2026年1月28日 30 103 49

    数据集概述 本数据集为大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究的存档数据,包含两种大黄蜂(Bombus vosnesenskii和Bombus bifarius)的RADseq测序分析相关文件,涉及美国加州、俄勒冈州和华盛顿州山脉不同纬度和海拔的种群连通性、遗传多样性模式研究,共2个文件。 文件详解 README_for_data_uploads.txt...
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  • RAD_seq_Based_南极企鹅种群基因组比较与扩散机制研究数据

    2026年1月27日 30 159 44

    数据集概述 本数据集为南极企鹅种群基因组比较研究数据,基于RAD-seq技术获取5种企鹅(帝企鹅、王企鹅、阿德利企鹅、帽带企鹅、巴布亚企鹅)的全基因组数据,用于分析繁殖群体间的连通性模式,探究影响物种扩散的内在与外在屏障,揭示海洋生态位及海洋学因素对基因流的作用。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式) 文件名称:Gentoos_all-...
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  • RAD_seq_Based小黄鱼全基因组SNP资源开发与初步评估数据

    2026年1月26日 30 131 56

    数据集概述 本数据集为小黄鱼(Larimichthys polyactis)的全基因组单核苷酸多态性(SNP)资源,通过RAD-seq技术对两个种群的24个个体测序生成,包含27556个SNP位点。数据涉及遗传变异分析、种群分化检测及局部适应性评估,可支持小黄鱼种群遗传学与基因组学研究。 文件详解...
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  • Uist_2015_Based三刺鱼多种群免疫与生活史遗传关联研究数据

    2026年1月26日 30 10 5

    数据集概述 本数据集来自三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)多种群免疫与生活史关联的遗传研究,包含2015年Uist地区采样的实验数据。通过qPCR量化免疫基因表达、RAD-seq分析基因组变异,探究野生种群免疫变异与生活史策略的进化关系。数据集含7个文件,涵盖采样信息、基因位点、SNP数据、结构分析及统计结果等内容。 文件详解...
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  • Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据

    2026年1月11日 30 191 143

    数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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  • RAD_seq_SNP_Based欧洲鳗鲡变态期自然选择信号研究数据

    2026年1月23日 30 143 27

    数据集概述 本数据集为欧洲鳗鲡生命周期变态阶段自然选择信号研究相关数据,包含编码基因SNP标记与RAD-seq全基因组SNP数据,用于分析玻璃鳗(幼体)与银鳗(成体)阶段受选择的基因及通路,验证变态期适应性解耦假说。数据支持研究不同生命周期阶段的选择压力差异及进化机制。 文件详解 文件名称:SNP_Table_BMCGenomicspaper.xlsx...
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  • Ligidium_Japan_Based_陆生等足类系统地理分析数据

    2026年1月23日 30 209 24

    数据集概述 本数据集包含日本陆生等足类Ligidium属的系统地理分析相关数据,基于721个个体的线粒体分析和83个个体的全基因组分析结果,揭示该属在日本东北与西南弧之间的系统发育分化及种群扩张历史,可用于研究地质历史与生物地理的关联。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Soldanella_Based_欧洲高山植物基因渐渗与物种分化研究数据

    2026年1月22日 30 128 121

    数据集概述 本数据集聚焦欧洲高山植物Soldanella属(报春花科)的基因渐渗研究,整合了质体基因组、核基因组(RAD-seq)及细胞遗传学数据,分析杂交与渐渗在该属快速分化中的作用。数据覆盖属内物种演化历史中的基因流动模式,尤其关注喀尔巴阡物种的核型变异与渐渗程度,揭示杂交对物种形成和遗传多样性的影响。 文件详解 README文件...
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  • Undaria_pinnatifida_Based_群体基因组学研究数据

    2026年1月22日 30 142 63

    数据集概述 本数据集为引入栽培太平洋海带Undaria pinnatifida的群体基因组学研究数据,包含码头、养殖场及自然岩礁三种栖息地种群的遗传信息。通过RAD-seq和微卫星两种方法分析,探究栖息地对种群遗传多样性、连通性及野外定殖的影响,共含2个文件。 文件详解 Guzinski-et-al-Undaria-RADseqVCF file.vcf...
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  • 蓝鱼_Scomber_scombrus_基于大西洋的蓝鱼种群结构研究数据

    2026年1月21日 30 70 42

    数据集概述 本数据集来自大西洋鲭鱼(Scomber scombrus)种群结构研究,包含高质量基因组测序及注释结果(741 Mb),并利用RAD-seq技术进行SNP标记发现与基因分型。研究基于数千个SNP标记分析,结果显示大西洋鲭鱼分为西北大西洋、东北大西洋、地中海三个遗传单元,未发现产卵群体存在遗传分化的证据。数据集包含9个相关文件。 文件详解...
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  • plains_zebra_Based_种群结构遗传多样性条纹异常分析数据

    2026年1月21日 30 138 76

    数据集概述 本数据集围绕平原斑马的种群结构、近交情况及条纹异常展开研究,包含140个平原斑马样本(含7个条纹异常个体)的遗传数据,覆盖非洲9个采样点。通过RAD-seq和WGS技术分析,探究种群结构、遗传多样性与异常表型的关系,为斑马保护策略提供科学依据。 文件详解 README 文件格式:无扩展名...
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  • RAD_seq_Evidence_Pitcairnia_lanuginosa局部适应研究数据

    2026年1月17日 30 65 7

    数据集概述 本数据集包含Neotropical凤梨科植物Pitcairnia lanuginosa的RAD-seq基因数据与性状数据,用于研究该斑块状分布物种在强遗传漂变下的局部适应证据。数据涵盖巴西塞拉多和安第斯永加斯种群的SNP标记及常见园实验的生理生态性状,支持种群分化、遗传漂变与选择作用的分析,共3个文件。 文件详解 种群基因数据压缩包...
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  • RAD_seq_MassARRAY_北美东部橡树核DNA条形码及植物园杂交研究数据

    2026年1月15日 30 72 37

    数据集概述 本数据集为北美东部8种常见白橡树核DNA条形码研究及植物园杂交分析相关数据。研究通过RAD-seq技术开发含80个SNP的条形码工具包,结合MassARRAY技术验证,分析Morton Arboretum中移栽橡树与本地树种的杂交情况。包含5个文件,涉及SNP提取脚本、不同筛选阶段的SNP矩阵及基因座序列压缩包。 文件详解...
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