数据集概述
本数据集围绕平原斑马的种群结构、近交情况及条纹异常展开研究,包含140个平原斑马样本(含7个条纹异常个体)的遗传数据,覆盖非洲9个采样点。通过RAD-seq和WGS技术分析,探究种群结构、遗传多样性与异常表型的关系,为斑马保护策略提供科学依据。
文件详解
- README
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:说明数据集的构建背景、筛选标准(如测序深度、Hardy-Weinberg平衡、基因型缺失率过滤条件)及三个子数据集的用途(种群结构分析、遗传多样性与近交分析、条纹异常个体近交比较)
- dataset1.vcf.gz
- 文件格式:VCF.GZ
- 字段映射介绍:压缩的VCF格式文件,包含种群结构分析相关的基因型数据
- dataset2_3.vcf.gz
- 文件格式:VCF.GZ
- 字段映射介绍:压缩的VCF格式文件,包含遗传多样性、近交分析及条纹异常个体比较相关的基因型数据
- SampleData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:样本数据表格,可能包含样本编号、采样位置、表型信息(正常/异常条纹)等基础元数据
适用场景
- 野生动物种群遗传学研究: 分析平原斑马的种群结构、遗传多样性分布及地理隔离对基因流的影响
- 近交与表型关联分析: 探究条纹异常表型与近交水平的遗传关联性
- 保护生物学策略制定: 基于种群遗传健康状况,制定针对性的平原斑马保护与栖息地连通性恢复方案
- 分子生态学技术应用: 验证RAD-seq和WGS技术在大型哺乳动物遗传研究中的适用性与数据分析方法