找到69个数据集

标签: VCF格式

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  • 灰猫头鹰种群的基因组多样性与结构数据

    2026年2月15日 30 86 6

    数据集概述 本数据集为北美大灰猫头鹰南部间断分布区种群基因组多样性与结构研究的相关数据,包含样本信息、基因组组装文件、SNP变异数据及分析脚本等10个文件,覆盖样本信息、基因序列、变异位点和分析工具等内容,用于研究该物种边缘种群的遗传分化、多样性及保护相关问题。 文件详解 样本与ID文件...
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  • 老鼠Y染色体的序列与结构多样性研究数据

    2026年2月9日 30 70 11

    数据集概述 本数据集用于研究小鼠Y染色体的序列和结构多样性,包含VCF格式的单核苷酸变异(SNV)及小插入缺失(small indel)变异数据,以及Excel格式的样本清单,共5个文件。数据支持小鼠Y染色体遗传变异特征的分析,为相关生命科学研究提供基础数据。 文件详解 变异数据文件(VCF.gz)...
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  • Caribbean_Based_加勒比红树林繁殖体扩散差异研究数据

    2026年2月6日 0 102 28

    数据集概述 本数据集围绕加勒比地区两种红树林(白红树Laguncularia racemosa与红树Rhizophora mangle)的繁殖体扩散差异展开,包含叶绿体基因组、核标记序列、海洋洋流数据及补充文档,用于研究海漂适应性陆生植物的遗传变异地理分布机制,涉及基因流、洋流影响等关键问题。 文件详解 基因组序列文件(.fasta格式)...
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  • GT_seq_西部响尾蛇种群结构基因分型保护数据

    2026年2月1日 30 21 9

    数据集概述 本数据集通过GT-seq技术对加拿大西部及美国华盛顿州的西部响尾蛇(Crotalus oreganus)样本进行基因分型,包含362个SNP位点的362份样本数据,用于分析种群结构、遗传多样性及地理隔离程度,为该濒危物种的保护单元划定提供科学依据。 文件详解 文件名称:Locus_info_362.csv 文件格式:CSV...
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  • Salmo_ischchan_塞凡湖鳟鱼基因组进化研究数据

    2026年1月30日 30 1 0

    数据集概述 本数据集为塞凡湖鳟鱼(Salmo ischchan)物种群进化研究的基因组数据,包含6个文件,涵盖线粒体DNA多序列比对、核基因SNP数据、进化分析相关的数据文件及说明文档,支持系统发育树构建、群体结构分析、基因流检测等进化生物学研究,助力解析塞凡湖鳟鱼物种群的形成机制与进化历史。 文件详解 核基因SNP数据文件...
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  • Sturgeon_Based_鲟鱼保护基因组学SNP标记数据

    2026年1月29日 30 205 2

    数据集概述 本数据集为鲟鱼保护基因组学研究的SNP标记数据,通过RAD测序技术对四种鲟鱼(Adriatic、Russian、Persian、Siberian)进行SNP标记发现与验证,包含候选SNP标记信息及相关说明文档,共2个文件,用于鲟鱼物种、种群及个体水平的遗传鉴定与保护管理。 文件详解...
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  • Impatiens_Based植物大小层级位置遗传变异研究数据

    2026年1月29日 30 170 69

    数据集概述 本数据集围绕一年生植物Impatiens capensis(凤仙花)自然种群展开,通过对种群大小分布中不同位置个体的基因分型,探究植物大小层级位置的遗传变异情况。研究发现,考虑种群结构后,未检测到大小层级位置存在显著遗传变异,提示植物适合度进化速率可能受限于现有遗传变异水平。 文件详解 基因分型文件(.vcf格式)...
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  • Dryad_Based_里奥格兰德流域特有鲤科鱼类遗传评估数据

    2026年1月28日 30 24 3

    数据集概述 本数据集针对美国西南部及墨西哥里奥格兰德流域受栖息地改变影响的两种特有鲤科鱼类——里奥格兰德闪鳞鱼(Notropis jemezanus)和斑点银汉鱼(Macrhybopsis aestivalis)开展遗传评估,分析其种群遗传变异、遗传独特性及潜在局部适应性,为物种保护提供遗传学依据。 文件详解 Final.Nj.mac.hap.vcf...
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  • Genetic_basis_针叶树高纬度林线干旱胁迫生长反应数据

    2026年1月28日 30 152 74

    数据集概述 本数据集包含广泛分布针叶树在高纬度林线过渡带干旱胁迫下生长反应的遗传基础研究相关数据,涵盖原始及过滤的SNP数据、树木年轮原始数据,以及用于SNP过滤、表型数据处理和基因型-表型关联分析的R脚本,共十一个文件。 文件详解 代码文件(.r格式,共6个) 文件名称:Genesis_multiple...
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  • Quercus_aquifolioides_气候适应性基因研究数据

    2026年1月27日 30 125 25

    数据集概述 本数据集为川滇高山栎气候适应性研究相关数据,涵盖60个种群587个个体的干旱胁迫候选基因测序结果,包含381个SNP位点与8个微卫星标记的遗传信息,支持分析该物种不同谱系(西藏、横断山-川西高原)的遗传多样性、适应性位点及未来气候适应风险。 文件详解 文件名称:SSR_All.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Caribbean_Based_加勒比红树林繁殖体扩散差异研究数据

    2026年1月27日 30 104 88

    数据集概述 本数据集围绕加勒比地区两种红树林(白红树Laguncularia racemosa与红树Rhizophora mangle)的繁殖体扩散差异展开,包含叶绿体基因组、核标记序列、海洋洋流数据及补充文档,用于研究海漂适应性陆生植物的遗传变异地理分布机制,涉及基因流、洋流影响等关键问题。 文件详解 基因组序列文件(.fasta格式)...
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  • RAD_seq_Based_南极企鹅种群基因组比较与扩散机制研究数据

    2026年1月27日 30 16 4

    数据集概述 本数据集为南极企鹅种群基因组比较研究数据,基于RAD-seq技术获取5种企鹅(帝企鹅、王企鹅、阿德利企鹅、帽带企鹅、巴布亚企鹅)的全基因组数据,用于分析繁殖群体间的连通性模式,探究影响物种扩散的内在与外在屏障,揭示海洋生态位及海洋学因素对基因流的作用。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式) 文件名称:Gentoos_all-...
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  • Sebastes_diaconus_石鱼耳石形态与基因组变异研究数据

    2026年1月26日 30 171 118

    数据集概述 本数据集围绕东北太平洋石鱼(Sebastes diaconus)的种内变异展开,包含其基因组变异与耳石形态数据。研究覆盖俄勒冈海岸近岸与离岸共3个采样点,分析了15000余个中性基因座的遗传差异及耳石形态的性二态性,为理解该物种种群结构及管理提供基础数据。 文件详解 基因组数据文件 VCF格式文件(5个):包括deacon-three-...
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  • ebola_Based_塞拉利昂埃博拉病毒感染病例评估数据集v1_2

    2026年1月26日 30 197 137

    数据集概述 本数据集记录了2014年5月25日至6月18日期间,塞拉利昂Kenema Government Hospital评估的213例埃博拉病毒感染病例信息,数据版本为v1.2,支持对埃博拉临床特征及预后的研究。 文件详解 文件名称:ebola-1.2.zip 文件格式:ZIP...
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  • Chorthippus_Based_蚱蜢种群基因组扫描表型分化研究数据

    2026年1月26日 30 110 107

    数据集概述 本数据集为Chorthippus属蚱蜢的种群基因组扫描数据,包含三种蚱蜢(Chorthippus biguttulus、C. mollis、C. brunneus)的基因组变异信息。通过RNA-seq技术分析物种间功能变异,识别受选择位点及相关基因,涉及鸣叫、听觉、食性偏好等表型分化相关基因,共14个文件。 文件详解...
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  • 混合区杂交图谱映射_奥杜邦协会与默特尔林莺羽毛色素沉着相关基因位点数据

    2026年1月23日 30 41 17

    数据集概述 本数据集通过Audubon林莺与myrtle林莺杂交区的自然混合群体,识别与黑色素和类胡萝卜素两种色素沉着相关的基因组区域。针对五种羽毛颜色性状,发现多个显著关联的SNP位点,集中在离散基因组区域,为羽毛色素沉着的遗传基础研究提供数据支持。 文件详解 基因位点数据文件...
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  • CX_5461_第一阶段试验中DNA修复缺陷实体瘤患者的变异性分析报告

    2026年1月22日 30 109 100

    数据集概述 本数据集包含CX-5461(首创新型G-四链体稳定剂)I期临床试验中,DNA修复缺陷晚期实体瘤患者的变异位点数据(Variant Calls),对应试验编号为CCTG IND.231。数据集共88个文件,涵盖患者样本的变异位点信息及数据映射文件,可用于分析药物相关的基因变异特征。 文件详解 变异位点文件(VCF格式)...
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  • SIG4_Based_波恩生物信息学核心单元基因组变异检测基准测试数据集

    2026年1月22日 30 121 83

    数据集概述 本数据集是波恩生物信息学核心单元使用Nvidia Clara Parabricks流程生成的SIG4基准测试数据,用于hg38参考基因组的种系变异检测。包含全外显子测序(WES)、全基因组测序(WGS)、合成基因组及结构变异(SV)等多种类型的变异检测基准数据,共15个文件。 文件详解 变异检测文件(.vcf.gz格式)...
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  • Npumilio_Based_巴塔哥尼亚树木局部适应性候选基因与变异数据

    2026年1月22日 30 190 22

    数据集概述 本数据集围绕巴塔哥尼亚建群树种Nothofagus pumilio的局部适应性研究,包含6个核心文件,涵盖特定候选基因列表、探针设计信息、SNP变异数据、样本元数据及直系同源群数据。数据支持该树种适应性相关基因的注释、变异分析及样本地理信息关联,为树木遗传学研究提供基础数据。 文件详解...
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  • plains_zebra_Based_种群结构遗传多样性条纹异常分析数据

    2026年1月21日 30 165 9

    数据集概述 本数据集围绕平原斑马的种群结构、近交情况及条纹异常展开研究,包含140个平原斑马样本(含7个条纹异常个体)的遗传数据,覆盖非洲9个采样点。通过RAD-seq和WGS技术分析,探究种群结构、遗传多样性与异常表型的关系,为斑马保护策略提供科学依据。 文件详解 README 文件格式:无扩展名...
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