数据集概述
本数据集围绕一年生植物Impatiens capensis（凤仙花）自然种群展开，通过对种群大小分布中不同位置个体的基因分型，探究植物大小层级位置的遗传变异情况。研究发现，考虑种群结构后，未检测到大小层级位置存在显著遗传变异，提示植物适合度进化速率可能受限于现有遗传变异水平。
文件详解
- 基因分型文件（.vcf格式）
- 文件名称：chr3.vcf、chr6.vcf、chr9.vcf、populations.snps.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含植物个体的单核苷酸多态性（SNP）位点信息，记录染色体位置、等位基因类型及各样本基因型数据
- 表型数据文件
- 文件名称：Phenotypes_QuadratsA-C.xlsx、Phenotypes_of_genotyped_plants.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录植物个体的表型数据，可能包含大小层级位置、样方信息等表型指标
- 群体结构文件
- 文件名称：pop367.bed、pop367.bim、pop367.fam、pop367.map
- 文件格式：BED、BIM、FAM、MAP
- 字段映射介绍：存储群体遗传结构数据，包括样本亲缘关系、标记位置及群体分层信息
- 辅助文件
- 文件名称：README.md、Phen367.txt
- 文件格式：MD、TXT
- 字段映射介绍：README.md为数据集说明文档；Phen367.txt记录样本编号与表型对应关系，如Plate1 A01等样本的表型数据
数据来源
论文“Position in the plant size hierarchy is not heritable”
适用场景
- 植物群体遗传学研究：分析植物大小层级位置的遗传基础及种群结构影响
- 适合度进化速率评估：探究遗传变异对植物适合度进化的约束作用
- 表型-基因型关联分析：结合表型数据与基因分型结果，挖掘影响植物大小的遗传位点
- 植物种群动态研究：通过大小层级分布及遗传变异情况，解析种群结构与动态变化机制
