数据集概述
本数据集通过GT-seq技术对加拿大西部及美国华盛顿州的西部响尾蛇（Crotalus oreganus）样本进行基因分型，包含362个SNP位点的362份样本数据，用于分析种群结构、遗传多样性及地理隔离程度，为该濒危物种的保护单元划定提供科学依据。
文件详解
- 文件名称：Locus_info_362.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含基因座信息，字段有Locus Name（基因座名称）、Allele1（等位基因1）、Allele2（等位基因2）、ProbeSeq1（探针序列1）、ProbeSeq2（探针序列2）、FWD_Primer（正向引物）、A1_correction（等位基因1校正值）、A2_correction（等位基因2校正值）。
- 文件名称：Metadata_488_alt.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本元数据文件，包含488个样本的相关信息（具体字段未详细说明，推测为采样地点、个体编号、地理区域等）。
- 文件名称：GT-seq_308_488.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：基因分型数据文件，包含308个样本的362个SNP位点的基因型信息（VCF标准格式，包含染色体位置、等位基因、基因型等字段）。
数据来源
论文“Genotyping-in-Thousands by sequencing reveals marked population structure in Western Rattlesnakes to inform conservation status”
适用场景
- 濒危物种保护单元划定：分析西部响尾蛇种群遗传结构，为加拿大濒危响尾蛇的保护单元重新评估提供数据支持。
- 种群遗传学研究：探究地理隔离对种群遗传多样性、基因流及种群分化的影响。
- 保护生物学决策：基于种群遗传结构和隔离程度，制定针对性的保护策略，如优先保护遗传独特性高的种群。
- 基因分型技术应用：验证GT-seq技术在野生种群多尺度遗传分析中的有效性，为其他濒危物种研究提供方法参考。
