数据集概述
本数据集为北美大灰猫头鹰南部间断分布区种群基因组多样性与结构研究的相关数据，包含样本信息、基因组组装文件、SNP变异数据及分析脚本等10个文件，覆盖样本信息、基因序列、变异位点和分析工具等内容，用于研究该物种边缘种群的遗传分化、多样性及保护相关问题。
文件详解
- 样本与ID文件
- 文件名称：sample_information.xlsx、individual_IDs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究中123个个体的样本信息及个体ID对应关系
- 基因组组装文件
- 文件名称：assembly_GG_rep_comb_0.95.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：大灰猫头鹰基因组组装序列文件
- 变异数据文件
- 文件名称：variants_4817snps_123inds.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含123个个体4817个SNP位点的变异信息
- 分析脚本文件
- 文件名称：parse_barcodes.pl、splitFastq.pl、gl2genest.pl、vcf2mpgl.pl、PCA_function.R、Fst_function.R
- 文件格式：PL、R
- 字段映射介绍：包含条形码解析、Fastq文件拆分、格式转换（VCF转MPGL等）、PCA分析、Fst计算等功能的分析脚本
数据来源
论文“Population genomic diversity and structure at the discontinuous southern range of the Great Gray Owl in North America”
适用场景
- 种群基因组学研究: 分析大灰猫头鹰南部边缘种群的遗传多样性、种群结构及分化程度
- 保护遗传学应用: 评估边缘种群的遗传脆弱性，为物种保护策略制定提供数据支持
- 基因组数据分析方法验证: 利用提供的脚本和数据测试SNP分析、PCA、Fst计算等基因组学分析流程
- 生物地理学研究: 结合遗传数据探讨物种间断分布区的形成机制及种群动态历史
