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灰猫头鹰种群的基因组多样性与结构数据
2026年2月15日 30 164 141
数据集概述 本数据集为北美大灰猫头鹰南部间断分布区种群基因组多样性与结构研究的相关数据,包含样本信息、基因组组装文件、SNP变异数据及分析脚本等10个文件,覆盖样本信息、基因序列、变异位点和分析工具等内容,用于研究该物种边缘种群的遗传分化、多样性及保护相关问题。 文件详解 样本与ID文件...
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柳莺迁徙表型遗传差异研究数据
2026年2月12日 30 131 71
数据集概述 本数据集围绕柳莺(Phylloscopus trochilus)迁徙表型的遗传差异展开,通过基因组从头组装、全基因组重测序及SNP芯片技术,分析波罗的海周边两种迁徙表型(西非越冬的SW迁徙型与东非/南非越冬的SSE迁徙型)的基因组变异,识别出染色体1、3、5上的高分化区域及相关候选基因,为迁徙性状的遗传基础研究提供数据支持。 文件详解...
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鹅掌楸属物种的基因组资源数据
2026年2月12日 30 116 3
数据集概述 本数据集提供Podospora anserina物种复合体的基因组资源,包含该复合体剩余4个物种的染色体水平注释组装,以及共28个Podospora基因组的注释组装综合数据集。Podospora anserina是分子生物学、衰老等研究的模式生物,数据集为相关领域研究提供高质量基因组参考。 文件详解 文件名称:README.md...
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细菌共生研究_附录数据_微生物基因组分析
2026年2月9日 0 156 34
数据集概述 本数据集为"无脊椎动物、纤毛虫和藻类中隐秘细菌共生的进化与生态学研究"论文的附录数据,包含附录B1、C1、D1、E1等文件,涵盖基因组组装和使用的元数据、系统发育分析结果、功能注释数据及图表原始数据,支持论文各章节的研究结论。 文件详解 附录B1文件(Excel格式):包含基因组组装和使用的元数据(如 accession 号、CheckM...
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转座子防御_真菌王国_遗传因素_支持性数据
2026年2月1日 30 141 59
数据集概述 本数据集为真菌界转座子防御系统遗传因素系统筛选研究的支持信息,包含15张补充表格,覆盖1239个真菌基因组组装的元数据、重复序列分析、系统发育信号、基因共线性、蛋白质结构域、k-mer频率及关联映射等核心内容,用于解析真菌转座子防御系统的遗传基础。 文件详解 代码文件 文件名称:kmer_analysis.py 文件格式:.py...
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Glazer_三刺鱼基因组组装优化与适应性性状定位数据
2026年1月30日 30 67 30
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼基因组组装优化及适应性性状定位展开,包含通过GBS方法构建的连锁图谱数据,用于锚定、调整基因组 scaffolds,提升组装完整性;同时包含侧线板数量、鳃耙长度等进化性状的QTL定位结果,揭示适应性性状的遗传基础。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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澳大利亚蜥蜴种群结构与物种形成速率研究数据集
2026年2月1日 30 178 52
数据集概述 本数据集围绕澳大利亚蜥蜴种群结构与物种形成速率的关系展开,包含892个个体的基因组ddRAD数据,覆盖104个假定物种级支系(OTUs)。数据记录了种群分化程度、系统发育树及相关元数据,用于检验种群分化是否预测物种形成速率,是生物进化领域的重要实证研究资料。 文件详解 文件名称:S1_individuals_v3.csv 文件格式:CSV...
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WGS_Based第三章附录2测序组装统计数据
2026年2月1日 30 147 82
数据集概述 本数据集为第三章附录2的WGS统计数据,包含样本的基因组组装统计信息,如scaffold数量、组装长度、平均scaffold长度、最大scaffold、N50、N碱基计数、恢复基因数,以及汇总的平均组装长度、最小/最大长度和平均恢复基因数,共1个文件。 文件详解 文件名称:Chap3_WGS_assembly_stats.xlsx...
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iwc_Purgedups_VGP6工作流测试数据
2026年1月31日 30 109 84
数据集概述 本数据集为iwc工作流的测试数据,包含Purgedups VGP6相关的基因组组装及分析文件,涵盖预估基因组大小参数、Hifiasm组装结果、Meryl数据库、Genomescope模型参数和Pacbio测序数据等,共6个文件,用于生物信息学工作流的测试验证。 文件详解 预估基因组大小参数文件 文件名称:Estimated genome...
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HiFi_Based人类肠道微生物组完整基因组组装数据
2026年1月30日 30 131 101
数据集概述 本数据集基于人类粪便样本的HiFi宏基因组测序,包含从五个样本中组装得到的一百零二个人类肠道微生物完整宏基因组组装基因组(cMAGs)相关数据,涵盖基因组序列、GC偏斜模式图、覆盖度图谱及元数据,为肠道微生物研究提供高质量基因组资源。 文件详解 文件名称:cMAG_metadata.xlsx 文件格式:XLSX...
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青霉素PF_T2菌株基因组组装与注释_微生物基因组数据
2026年1月30日 30 166 101
数据集概述 本数据集为实验室培养获得的Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组组装与注释结果,包含7个相关文件。基因组组装长度35.1 Mb,BUSCO完整度97.9%,由5个支架/ contig组成,与模式标本基因组共线性,含特异性环匹阿尼酸(CPA)基因簇,是该物种优质基因组资源。 文件详解...
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NCBI_Based_脊椎动物基因组凭证标本信息摘要数据
2026年1月30日 30 183 106
数据集概述 本数据集为脊椎动物基因组相关的凭证标本信息摘要,凭证标本是永久保存于可访问馆藏的实体样本,是基因组组装分类鉴定的物理依据。数据聚焦NCBI中多数脊椎动物基因组未关联凭证标本的问题,包含相关信息摘要,助力推动基因组研究中凭证标本的规范存管与关联。 文件详解 文件名称:Supplementary_File_1.xlsx 文件格式:XLSX...
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LMAS_Source_微生物群落组装软件基准测试补充材料
2026年1月30日 30 73 23
数据集概述 本数据集为LMAS(自动化工作流程)的补充材料,包含用于基准测试传统及宏基因组原核生物从头组装软件的模拟数据与参考基因组信息。以ZymoBIOMICS微生物群落标准的8个细菌基因组和4个质粒(三重形式)为参考,通过inSilicoSeq生成带或不带错误的均匀分布模拟原始序列数据,共31个文件。 文件详解 表格文件(Tables)...
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Automeris_io_Based_高质量基因组组装数据
2026年1月30日 30 14 3
数据集概述 本数据集提供了Io蛾(Automeris io)的高质量PacBio HiFi基因组组装结果,旨在支持眼斑分子发育及反捕食防御进化的研究。Io蛾因显著的后翅眼斑成为研究拟态防御的新兴模型。数据集包含基因组组装相关的结果文件、注释文件及质量评估文件,共8个文件。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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meta3C_微生物染色体组织多样性研究数据_原始与说明文件
2026年1月29日 30 144 28
数据集概述 本数据集包含meta3C技术(宏基因组染色体构象捕获)相关的实验数据,用于研究微生物群落中染色体组织的多样性。通过细菌、酵母混合样本及环境样本的meta3C分析,验证了该技术在未知基因组组装、支架构建及三维结构表征中的应用潜力,共包含6个文件。 文件详解 说明文件(.txt格式)...
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Anellovirus_33种圆环病毒FASTQ数据集2023
2026年1月28日 30 30 28
数据集概述 本数据集包含三十三种圆环病毒的FASTQ数据,由十六组计算机模拟生成,核苷酸序列与2023年第一版灵长类圆环病毒数据库序列的一致性从百分之百到百分之八十五不等。数据通过art_illumina软件生成,可用于病毒基因组相关分析。 文件详解 文件名称:dataset-33Anelloviruses-2023.zip 文件格式:ZIP...
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Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据
2026年1月27日 30 197 94
数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果,包括首个低覆盖度(11X)基因组草图、单核苷酸多态性(SNP)及简单序列重复(SSR)标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小,含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息,可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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Marcussen_et_al_小麦祖先基因组杂交研究数据_压缩包
2026年1月27日 30 75 4
数据集概述 本数据集聚焦于面包小麦祖先基因组的古杂交事件研究,通过分析小麦及五倍体近缘种的基因组组装数据,探究其系统发育历史、进化关系与分化时间,揭示小麦基因组多轮杂交(同倍体与多倍体)的形成机制,为理解小麦基因组的多层次系统发育镶嵌结构提供基础。 文件详解...
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Drosophila_Sdic_Based基因家族早期进化研究数据
2026年1月27日 30 196 163
数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇特有串联重复基因家族Sdic展开,包含其在20个地理种群中的结构与功能进化研究数据。通过基因组组装、读深分析及qPCR等方法,探究该基因家族的拷贝数变异、转座元件插入、基因转换及选择压力等特征,为理解串联重复基因家族的早期进化路径提供支持。 文件详解 文件名称:Dataset_1.xlsx 文件格式:XLSX...
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Haloarchaea_Based_七株盐古菌基因组测序与比较分析数据
2026年1月26日 30 47 45
数据集概述 本数据集包含七株盐古菌(Haloferax和Haloarcula属)的基因组测序数据,测序覆盖度约20倍,组装后平均50个contigs。数据揭示了两属间COG功能组富集差异、DNA代谢相关基因的属特异性扩张及基因水平转移现象,为古菌生物学研究提供支持。 文件详解 文件名称:RAST_Annotations.zip 文件格式:ZIP...



