数据集概述
本数据集围绕澳大利亚蜥蜴种群结构与物种形成速率的关系展开，包含892个个体的基因组ddRAD数据，覆盖104个假定物种级支系（OTUs）。数据记录了种群分化程度、系统发育树及相关元数据，用于检验种群分化是否预测物种形成速率，是生物进化领域的重要实证研究资料。
文件详解
- 文件名称：S1_individuals_v3.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含SAMPLE_ID（样本编号）、GENUS（属名）、SPECIES（种名）、LAT（纬度）、LON（经度）、reads（测序读数）、SRA_accession（序列存档编号）等个体样本元数据。
- 文件名称：species.tre、otu.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：分别为基于物种和假定物种级支系（OTUs）构建的系统发育树文件，记录物种间的进化关系。
- 文件名称：beast_ucln_31July17.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST软件的分析配置文件，包含物种分化时间估算的参数设置。
- 文件名称：assemblies.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包文件，包含基因组组装相关数据。
数据来源
论文“Does population structure predict the rate of speciation? A comparative test across Australia's most diverse vertebrate radiation”
适用场景
- 生物进化研究：分析种群结构与物种形成速率的关系，验证种群分化是否为物种形成的限速步骤。
- 系统发育分析：利用系统发育树文件研究澳大利亚蜥蜴的进化关系与分化历史。
- 种群遗传学研究：通过个体样本元数据和基因组数据，探究蜥蜴种群的遗传分化与地理分布的关联。
- 宏观进化因素分析：结合种群结构与物种形成速率数据，识别影响宏观进化尺度物种形成的关键生态与历史因素。
