数据集概述
本数据集为"无脊椎动物、纤毛虫和藻类中隐秘细菌共生的进化与生态学研究"论文的附录数据，包含附录B1、C1、D1、E1等文件，涵盖基因组组装和使用的元数据、系统发育分析结果、功能注释数据及图表原始数据，支持论文各章节的研究结论。
文件详解
- 附录B1文件（Excel格式）：包含基因组组装和使用的元数据（如 accession 号、CheckM 分数、GTDBtk 分类学结果），以及第二章支持数据；黄色标签含物种信息、宿主环境、基因组长度等元数据，红色标签含系统发育网络分析Phi值及功能富集表
- 附录C1文件（Excel格式）：包含基因组组装和使用的元数据，以及第三章图表原始数据；黄色标签含基因组元数据表和额外基因组accession号，红色标签含AAI/ANIb相似度数据、KEGG注释结果、基因簇存在-缺失矩阵等
- 附录D1文件（Excel格式）：包含基因组组装和使用的元数据，以及第四章图表原始数据；黄色标签含本研究组装基因组、环境MAGs、衣原体门基因组的元数据，红色标签含AAI/ANIb相似度网络数据、CRISPRcas结果、KEGG通路完整性等
- 附录E1文件（Excel格式）：包含PCR筛选结果、环境数据及额外基因组信息；黄色标签含德国按蚊中"Ca. Tisiphia"的PCR筛查和地理数据、额外基因组accession号，红色标签含KEGG完整性和ko_hits数据
数据来源
论文"Investigating the Evolution and Ecology of Obscure Bacterial Symbioses found in Invertebrates, Ciliates and Algae"
适用场景
- 微生物基因组学研究：用于分析细菌共生体的基因组特征、分类学地位及进化关系
- 微生物生态学分析：探究细菌共生体与宿主的关联、环境适应性及代谢功能
- 系统发育网络研究：利用Phi值、AAI/ANIb相似度数据构建细菌共生体的系统发育关系
- 功能基因组学分析：通过KEGG注释、基因簇存在-缺失矩阵研究细菌共生体的代谢通路和功能基因分布
- 生物信息学方法验证：验证基因组组装质量评估（CheckM）、分类学注释（GTDBtk）等生物信息学工具的应用效果
