青霉素PF_T2菌株基因组组装与注释_微生物基因组数据

数据集概述

本数据集为实验室培养获得的Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组组装与注释结果,包含7个相关文件。基因组组装长度35.1 Mb,BUSCO完整度97.9%,由5个支架/ contig组成,与模式标本基因组共线性,含特异性环匹阿尼酸(CPA)基因簇,是该物种优质基因组资源。

文件详解

  • Pf_T2_v1.0.fa
  • 文件格式:FA
  • 字段映射介绍:基因组组装序列文件
  • Pf_T2_v1.0.Transcripts.fa
  • 文件格式:FA
  • 字段映射介绍:转录本序列文件
  • Pf_T2_v1.0.Genes.gff3
  • 文件格式:GFF3
  • 字段映射介绍:基因注释文件
  • Pf_T2_v1.0_ncGenes.gff
  • 文件格式:GFF
  • 字段映射介绍:非编码基因注释文件
  • Pf_T2_v1.0.Proteins.fa
  • 文件格式:FA
  • 字段映射介绍:蛋白质序列文件
  • Pf_T2_v1.0_TEanno.gff3
  • 文件格式:GFF3
  • 字段映射介绍:转座元件注释文件
  • Pf_T2_antismash_output.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:抗生素合成基因簇分析结果压缩包

适用场景

  • 微生物基因组学研究: 用于分析Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组结构与特征
  • 基因功能注释分析: 基于基因、转录本、蛋白质序列文件开展功能注释研究
  • 次级代谢产物分析: 利用抗生素合成基因簇分析结果研究环匹阿尼酸等代谢产物合成机制
  • 物种进化研究: 通过基因组共线性分析探讨该菌株与模式标本的进化关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 156.51 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。