找到16个数据集

标签: 微生物基因组学

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  • 细菌UL23_01_03的DFAST分析数据集

    2025年12月18日 30 39 5

    数据集概述 本数据集为细菌UL23-01-03的DFAST分析结果,包含基因组序列、注释信息、质量检查报告及功能分析数据,覆盖RNA、蛋白质、基因特征等多维度生物学信息,为该细菌的分子生物学研究提供全面数据支持。 文件详解 序列与注释文件: rna.fna.txt:TXT格式,包含tRNA等RNA序列信息...
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  • 几丁质酶系统发育基因组学分析补充信息数据集

    2025年12月16日 30 128 7

    数据集概述 本数据集为几丁质酶系统发育基因组学分析的补充信息,包含基因序列分析、系统发育树构建及相关文档,核心研究蓝细菌中几丁质降解和肽聚糖循环途径基因的水平基因转移(HGT)现象,支持海洋SynPro几丁质酶基因融合进化机制的研究。 文件详解 README_SI_TEXT_1.txt:文本格式,可能为研究文本部分的说明文档...
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  • 古菌DPANN共生体从宿主选择性脂质募集数据集

    2025年12月16日 30 142 2

    数据集概述 本数据集围绕古菌DPANN共生体(Ca. Nanohaloarchaeum antarcticus)与其宿主(Halorubrum lacusprofundi)的脂质组动态展开,记录共生体从宿主选择性募集的脂质种类及宿主脂质组响应变化,为研究该共生关系的脂质交换机制提供数据支持。 文件详解...
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  • 土壤氧化还原条件波动下生物地球化学氮循环路径组织数据集

    2025年12月15日 30 210 190

    数据集概述 该数据集围绕土壤氧化还原条件波动下生物地球化学氮循环路径的组织机制展开,通过动力学建模、动态系统理论与微生物基因组学方法,探究氮循环网络的适应性与稳定性,以及人为压力对系统稳定性的影响。 文件详解 文件名称: Nitrogen_Biogeochemical_Network_Sanjay_Lamba_Chakraborty_ESM.pdf...
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  • GraphBin_Tk_Based_微生物群落分箱测试完整数据集_注_因无具体时间信息_所有风格统一使用_完整数据_作为时间后缀_确保涵盖三个模拟数据集及结果的全部内容

    2025年12月14日 30 172 108

    数据集概述 该数据集包含GraphBin-Tk手稿的示例数据集和结果,原始数据源自GraphBin2手稿,涵盖三个模拟微生物群落数据集(含5、10、20种细菌),所有数据均通过metaSPAdes组装,支持GraphBin-Tk相关研究。 文件详解 数据集文件: Sim-5G.zip: ZIP格式压缩文件,包含含5种细菌物种的模拟数据集...
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  • STEC感染临床结局预测补充数据集

    2025年12月14日 30 79 40

    数据集概述 本数据集为STEC感染临床结局预测相关研究的补充数据,包含测试集分离株结局预测、特征注释、SHAP值、模型超参数调优等多类文件,为分析STEC感染临床结局预测模型提供支持。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,内部包含多个补充数据集,具体说明如下: - 文件名称: STEC_ML_Supplementary_dataset.zip -...
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  • 化脓性链球菌泛基因组基因必要性评估数据集

    2025年12月13日 30 19 8

    数据集概述 本数据集包含使用Transit工具包对化脓性链球菌转座子测序数据集分析的原始输出文件,涉及九组Tn5-like和Himar1-like转座子数据,涵盖泛基因组关系、必要性、操纵子必要性等多维度分析结果。 文件详解 该数据集包含25个文件,无目录结构,具体说明如下: - 主要数据文件(.tsv格式,16个): -...
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  • 赞比亚小麦瘟疫情全球大流行谱系独立引入基因组分析数据集

    2025年12月12日 30 48 7

    数据集概述 本数据集基于OpenWheatBlast倡议共享的全基因组测序数据,分析赞比亚小麦瘟疫情菌株与不同宿主稻瘟病菌的基因组分化,验证其与孟加拉国疫情菌株的相似性及可能的南美起源,为小麦瘟全球传播研究提供基因组证据。 文件详解 文件名称: Document_WheatBlast_Zambia_Croll__01April2021.pdf...
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  • 选择性消化道去污染对产超广谱β_内酰胺酶大肠杆菌泛基因组组成影响的补充数据集

    2025年12月12日 30 147 13

    数据集概述 本数据集为“选择性消化道去污染对产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌(ESBL-E. coli)泛基因组组成影响”研究的补充数据,提供研究相关的附加信息,支持对该主题的深入分析。 文件详解 文件名称: Supplementary_Data.zip 文件格式: ZIP(压缩包格式) 内容说明:...
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  • Progenio病原菌比较蛋白质基因组学分析补充数据集

    2025年12月12日 30 49 24

    数据集概述 该数据集为病原菌比较蛋白质基因组学分析的补充数据,围绕两种毒力差异的北京家族结核分枝杆菌菌株展开,支持Progenio分析流程的验证与应用,包含表格、序列、图像等多类型文件。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 表格文件(.xlsx,15个): -...
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  • 瑞士即食肉制品中抗生素耐药菌数据集

    2025年12月12日 30 62 5

    数据集概述 本数据集支持一项针对瑞士即食肉制品中抗生素耐药菌流行率与特征的研究。研究收集了瑞士肉铺的804份即食肉制品,分离出177株耐药菌(含148株多重耐药菌),涵盖ESBL、VRE等四类耐药菌。数据集包含表型耐药、耐药基因注释及耐药基因定位三类核心数据,为探究即食肉制品作为耐药菌潜在储存库提供支撑。 文件详解 文件名称:...
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  • DiscERN手稿的AntiSMASH输出数据集

    2025年12月12日 30 9 4

    数据集概述 该数据集包含通过DiscERN识别的假定CDAs、糖肽、大环内酯和利福霉素类生物合成基因簇(BGCs)的AntiSMASH 7.0注释结果,为天然产物生物合成研究提供注释数据支持。 文件详解 文件名称: smash_outputs_disc.zip 文件格式: ZIP (.zip) 文件内容: 压缩包内包含由AntiSMASH...
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  • 外生菌根真菌ITS1区域SRP_RNA多序列比对补充材料4

    2025年12月9日 60 164 97

    数据集概述 该数据集为外生菌根真菌相关研究的补充材料,核心内容是信号识别颗粒RNA(SRP RNA)的多序列比对文件,包含已有研究中的三种真菌SRP RNA序列与新生成的红菇属、乳菇属ITS序列的比对结果。 文件详解 文件名称: oo_88588.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含信号识别颗粒RNA(SRP...
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  • 芬兰_dairy_农场产志贺毒素大肠杆菌与空肠弯曲菌纵向研究支撑数据与代码

    2025年12月9日 30 57 3

    数据集概述 本数据集为“芬兰 dairy 农场产志贺毒素大肠杆菌与空肠弯曲菌纵向研究”的支撑数据与代码,包含统计模型、菌株基因组组装文件等,用于支持相关研究论文的复现与扩展分析。 文件详解 文件名称: Milk_contamination_model_v3.zip 文件格式: .zip 内容说明: 包含与牛奶污染相关的统计模型数据或代码 文件名称:...
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  • 印度尼西亚甘蔗根腐病病原菌竹生炭角菌分离株GMP_LS基因组草图序列数据集

    2025年12月9日 30 87 33

    数据集概述 本数据集包含印度尼西亚甘蔗根腐病病原菌竹生炭角菌分离株GMP-LS的基因组草图序列相关补充资料,包括补充图表和表格,为该病原菌的基因组研究提供支持。 文件详解 文件名称:MRA01043-23 Supplementary Table...
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  • 大肠杆菌与人类基因组Blastn比对分析数据集

    2025年12月5日 30 120 15

    数据集概述 本数据集记录了大肠杆菌(Ecoli U00096.2)与人类基因组(Hg38)的Blastn比对分析结果,包含两者基因组序列的相似性比对信息,涉及短片段及整体比对内容,为研究两者基因组互作及潜在疾病关联提供数据支持。 文件详解 文件名称: Ecoli Vs Human genome Hg38 Blastn short...
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