数据集概述
本数据集包含使用Transit工具包对化脓性链球菌转座子测序数据集分析的原始输出文件，涉及九组Tn5-like和Himar1-like转座子数据，涵盖泛基因组关系、必要性、操纵子必要性等多维度分析结果。
文件详解
该数据集包含25个文件，无目录结构，具体说明如下：
- 主要数据文件（.tsv格式，16个）：
- 示例文件：MGAS2221_NecMyo_30667377_resampling_betagenom.tsv、MGAS27961_NecMyo_30667377_Tn5Gaps.tsv等
- 内容：转座子测序分析的原始输出，包括重采样结果、转座子间隙信息等
- 表格数据文件（.csv格式，4个）：
- Data_S1_pan_genome_relation_table.csv：泛基因组关系表
- Data_S2_pan_genome_essentiality_table.csv：泛基因组必要性表
- Data_S3_vivo_vitro_diff.csv：体内外差异数据
- Data_S4_operon_essentiality_table.csv：操纵子必要性表
- 补充表格文件（.xlsx格式，2个）：
- Table_S1_Tn_seq_library_stats.xlsx：转座子测序文库统计
- Table_S2_Major_COG_supp_table.xlsx：主要COG功能分类补充表
- 网页预览文件（.html格式，3个）：
- HTML_S1_pan_genome_relation_table.html：泛基因组关系表网页预览
- HTML_S2_pan_genome_essentiality_table.html：泛基因组必要性表网页预览
- HTML_S3_operon_essentiality_table.html：操纵子必要性表网页预览
适用场景
- 微生物基因组学研究：分析化脓性链球菌泛基因组的基因必要性特征
- 转座子测序数据分析：验证Transit工具包在Tn-seq数据处理中的应用效果
- 细菌功能基因组学：探究不同菌株（如MGAS2221、MGAS27961）在体内外环境下的基因必要性差异
- 分子微生物学：研究操纵子结构与基因必要性的关联
- 临床微生物学：解析化脓性链球菌致病相关基因的功能必要性
