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标签: 转座元件

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  • 青霉素PF_T2菌株基因组组装与注释_微生物基因组数据

    2026年1月30日 30 201 44

    数据集概述 本数据集为实验室培养获得的Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组组装与注释结果,包含7个相关文件。基因组组装长度35.1 Mb,BUSCO完整度97.9%,由5个支架/ contig组成,与模式标本基因组共线性,含特异性环匹阿尼酸(CPA)基因簇,是该物种优质基因组资源。 文件详解...
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  • Dryad_Based_mIDH1抑制激活肿瘤免疫机制研究数据

    2026年1月28日 30 6 5

    数据集概述 本数据集是关于突变型异柠檬酸脱氢酶1(mIDH1)抑制激活肿瘤免疫机制研究的补充数据,包含8个补充表格文件和1个说明文档,总计9个文件。核心内容为mIDH1抑制剂处理后肿瘤细胞系中转座元件(TE)的表达分析结果,支持研究mIDH1通过表观遗传抑制先天免疫、以及内源性逆转录酶活性与肿瘤免疫激活的关联机制。 文件详解 说明文档...
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  • Catharus_Based_鸫属隐存物种基因组数据集_2021

    2026年1月28日 30 8 7

    数据集概述 本数据集聚焦鸫属(Catharus)鸟类的隐存物种形成基因组学研究,包含比氏夜鸫(C. bicknelli)、灰颊夜鸫(C. minimus)及斯温氏夜鸫(C. ustulatus)的参考基因组与种群重测序数据,以及相关分析结果。数据用于探究物种分化历史、遗传分化、基因组结构及适应性进化过程,共包含2个核心文件。 文件详解...
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  • 芦笋目转座子元件低覆盖度基因组序列组装与比较分析数据_2013年

    2026年1月28日 30 174 158

    数据集概述 本数据集针对天门冬目(含洋葱、芦笋、龙舌兰等)11个代表性类群的低覆盖度单端Illumina数据,通过从头组装获得转座元件contig,结合单子叶重复序列参考库注释,估算核基因组中转座元件的相对比例,用于分析该类群转座元件演化模式。 文件详解 README_for_Asparagales.txt 文件格式:TXT...
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  • cephalochordate_Genome_五种头索动物基因组注释数据

    2026年1月22日 30 71 29

    数据集概述 本数据集包含五种头索动物(Asymmetron lucayanum、Branchiostoma belcheri、Branchiostoma floridae、Branchiostoma japonicum、Branchiostoma...
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  • Pst104E_Genome_Based小麦条锈菌核相位基因组组装注释数据

    2026年1月21日 30 105 89

    数据集概述 本数据集为小麦条锈菌(Puccinia striiformis f. sp. tritici)104 E137 A-(Pst104E)菌株的端粒到端粒核相位基因组组装与注释数据,包含基因组序列、基因注释、转座元件注释及补充表格,支撑该菌株的分子生物学研究。 文件详解 基因组序列文件...
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  • BioRxiv_Based_转座元件与流感感染可变应答关联研究数据集与脚本

    2026年1月21日 30 65 14

    数据集概述 本数据集包含论文“Transposable elements are associated with the variable response to influenza infection”的核心分析脚本与数据,聚焦转座元件(TEs)在流感病毒感染个体应答差异中的作用。涵盖转录组、ATAC-...
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  • AcMNPV_Based_大型双链DNA病毒基因组结构变异与转座元件研究数据

    2026年1月20日 30 30 2

    数据集概述 本数据集围绕大型双链DNA病毒基因组结构变异展开研究,通过短读长(Illumina)和长读长(PacBio)测序技术分析AcMNPV病毒基因组,识别出1141个结构变异(SVs)及1757个转座元件插入,并扩展验证了虹彩病毒和疱疹病毒的SV特征,揭示了SV在病毒种群中的动态演化规律。 文件详解 基因组序列与注释文件...
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  • Stress_DNA_Methylation_水稻磷酸盐胁迫响应表观遗传数据

    2026年1月20日 30 7 5

    数据集概述 本数据集记录水稻在磷酸盐饥饿及恢复条件下,全基因组亚硫酸氢盐测序分析得到的DNA甲基化(mC)时空动态变化。数据显示磷酸盐饥饿诱导的mC变化广泛存在且优先定位于高表达基因附近的转座元件(TEs),揭示转录与表观基因组变化的时间层级关系,为环境胁迫响应的表观遗传机制研究提供支撑。 文件详解 补充数据文件(共12个xlsx文件)...
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  • Pomacea_De_novo_assembly福寿螺转录组分子生态应用数据

    2026年1月20日 30 17 6

    数据集概述 本数据集为入侵物种福寿螺的转录组从头组装数据,包含128,436条unigenes(平均长度419bp)、2,439个含转座元件的unigenes、3,196个微卫星位点、15,412个ORF单核苷酸多态性(SNPs)及878个幼螺蛋白质组数据,支持入侵物种分子生态研究。 文件详解 文件名称:Pomacea_SNP.xlsx...
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  • Evening_Primroses_Based月见草基因组大小变异研究补充表格数据

    2026年1月15日 30 154 51

    数据集概述 本数据集为月见草(Oenothera)属基因组大小变异研究的补充表格,包含2个Excel文件。研究通过系统发育比较方法和全基因组测序,探究性别繁殖方式与转座元件含量对基因组大小变异的影响,发现有性/无性繁殖及转座元件丰度并非基因组大小近两倍差异的主因,较大基因组含更多简单序列重复。 文件详解 文件名称:Supplementary Table...
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  • LTR_retrotransposons_Based_无肺螈科蝾螈基因组巨型化研究数据

    2026年1月14日 30 41 7

    数据集概述 本数据集为无肺螈科蝾螈基因组巨型化研究的基因组 shotgun 测序数据,包含6种无肺螈科物种的测序数据。通过高通量测序技术生成,用于分析转座元件(TE)含量,探究其在蝾螈基因组扩张中的作用,特别是LTR逆转录转座子的贡献。 文件详解 文件名称:Plethodontid salamanders shotgun reads.zip...
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  • flycatcher_rho_Based_斑姬鹟种群全基因组连锁不平衡与重组率研究数据

    2026年1月14日 30 123 63

    数据集概述 本数据集基于两种近缘斑姬鹟(Ficedula albicollis和F. hypoleuca)多个种群的全基因组连锁不平衡(LD)模式,估算了精细尺度的种群重组率。数据揭示了物种间重组景观的保守性与局部差异,分析了遗传多样性、分化与重组率的关联,识别了种群特异性重组热点及其与CpG岛、转座元件的关联机制,为鸟类重组调控机制研究提供支撑。...
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  • Taraxacum_officinale_Based_无性生殖基因组转座元件动态变化研究数据

    2026年1月12日 30 102 7

    数据集概述 本数据集聚焦无性生殖植物蒲公英(Taraxacum officinale)的转座元件(TE)研究,包含5个TE簇相关的文本文件及1个直方图压缩文件。通过低覆盖度基因组测序、转录组和甲基化分析,揭示无性系内TE的动态变化、转录活性及甲基化差异,为理解无性生殖基因组演化提供数据支持。 文件详解...
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  • Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版

    2026年1月12日 30 90 52

    数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜(Melanaphis sacchari)的染色体级别基因组组装与注释数据,包含356.1 Mb基因组序列(其中85.5%位于3条常染色体和X染色体)、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因(BUSCO完整性达95.8%),以及系统发育分析相关信息,为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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  • Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据

    2025年12月30日 30 99 98

    数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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  • 转座元件全基因组扩展路径数据集

    2025年12月22日 30 18 8

    数据集概述 本数据集为博士论文第二章的补充文件,围绕转座元件在全基因组中的扩展路径展开,包含数据表和方法说明类文件,为相关研究提供补充数据支持。 文件详解 该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 数据文件(共2个): - Supplementary_Table_S2_metadata.xls:XLS格式数据表,可能包含转座元件相关的元数据信息 -...
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  • 乳腺癌肿瘤中L1和Alu元件补充文件数据集

    2025年12月20日 30 36 8

    数据集概述 本数据集包含与乳腺癌肿瘤中L1和Alu元件相关的补充文件,为研究该领域提供辅助资料支持。 文件详解 文件名称: Supplementary files for L1 and Alu in BC.zip 文件格式: ZIP压缩文件 内容说明: 压缩包内包含与乳腺癌肿瘤中L1和Alu元件研究相关的补充文件,具体内容需解压后查看 适用场景...
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  • 被子植物质体来源核DNA进化机制数据集

    2025年12月10日 30 42 3

    数据集概述 该数据集包含被子植物(开花植物)核DNA进化机制研究相关的基因组结构注释文件,覆盖三十种被子植物物种的核基因组非结构基因空间(转座元件与RNA基因)的统一重注释数据,为探究质体来源核DNA进化的偶发与持续机制提供支持。 文件详解 文件名称: Genome_structural_reannotation.zip 文件格式: ZIP压缩包...
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