数据集概述
本数据集包含论文“Transposable elements are associated with the variable response to influenza infection”的核心分析脚本与数据,聚焦转座元件(TEs)在流感病毒感染个体应答差异中的作用。涵盖转录组、ATAC-seq数据及相关分析结果,用于探究TEs的表观遗传调控与免疫应答的关联,为流感感染个体差异机制研究提供支持。
文件详解
- 文件名称:VariabilityInTEs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含论文主要分析所用的脚本与数据集,具体内容需解压后查看,推测涵盖转录组测序数据、ATAC-seq数据、TE家族可及性分析结果、表观遗传谱数据、基序分析结果及病毒载量关联分析数据等。
数据来源
BioRxiv论文“Transposable elements are associated with the variable response to influenza infection”(doi: https://doi.org/10.1101/2022.05.10.491101)
适用场景
- 免疫基因组学研究:分析转座元件在流感感染后免疫应答中的调控作用及个体差异机制。
- 表观遗传学分析:探究流感感染对转座元件可及性的影响及相关表观遗传调控模式。
- 病毒感染应答机制研究:关联转座元件表达与流感病毒载量的个体差异,揭示宿主应答调控通路。
- 生物信息学方法应用:复现论文中转录组、ATAC-seq及基序分析的流程与结果。