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标签: 转座元件分析

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  • 芦笋目转座子元件低覆盖度基因组序列组装与比较分析数据_2013年

    2026年1月28日 30 104 68

    数据集概述 本数据集针对天门冬目(含洋葱、芦笋、龙舌兰等)11个代表性类群的低覆盖度单端Illumina数据,通过从头组装获得转座元件contig,结合单子叶重复序列参考库注释,估算核基因组中转座元件的相对比例,用于分析该类群转座元件演化模式。 文件详解 README_for_Asparagales.txt 文件格式:TXT...
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  • BioRxiv_Based_转座元件与流感感染可变应答关联研究数据集与脚本

    2026年1月21日 30 123 81

    数据集概述 本数据集包含论文“Transposable elements are associated with the variable response to influenza infection”的核心分析脚本与数据,聚焦转座元件(TEs)在流感病毒感染个体应答差异中的作用。涵盖转录组、ATAC-...
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  • LTR_retrotransposons_Based_无肺螈科蝾螈基因组巨型化研究数据

    2026年1月14日 30 178 105

    数据集概述 本数据集为无肺螈科蝾螈基因组巨型化研究的基因组 shotgun 测序数据,包含6种无肺螈科物种的测序数据。通过高通量测序技术生成,用于分析转座元件(TE)含量,探究其在蝾螈基因组扩张中的作用,特别是LTR逆转录转座子的贡献。 文件详解 文件名称:Plethodontid salamanders shotgun reads.zip...
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  • Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据

    2025年12月30日 30 156 142

    数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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  • 被子植物质体来源核DNA进化机制数据集

    2025年12月10日 30 89 85

    数据集概述 该数据集包含被子植物(开花植物)核DNA进化机制研究相关的基因组结构注释文件,覆盖三十种被子植物物种的核基因组非结构基因空间(转座元件与RNA基因)的统一重注释数据,为探究质体来源核DNA进化的偶发与持续机制提供支持。 文件详解 文件名称: Genome_structural_reannotation.zip 文件格式: ZIP压缩包...
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  • Earl_Grey转座元件注释分析管道补充文件数据集

    2025年12月6日 30 180 56

    数据集概述 本数据集是Earl Grey转座元件注释分析管道的配套补充文件,包含参数选择说明、模拟基因组配置、参考注释、补充表格及结果图表等7个文件,为该自动化分析工具的使用与验证提供支持。 文件详解 文件名称: additionalFile1_BEATparameterSelection.docx 文件格式: DOCX (.docx) 内容说明:...
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