数据集概述
本数据集是关于突变型异柠檬酸脱氢酶1(mIDH1)抑制激活肿瘤免疫机制研究的补充数据,包含8个补充表格文件和1个说明文档,总计9个文件。核心内容为mIDH1抑制剂处理后肿瘤细胞系中转座元件(TE)的表达分析结果,支持研究mIDH1通过表观遗传抑制先天免疫、以及内源性逆转录酶活性与肿瘤免疫激活的关联机制。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集背景、数据描述及文件结构说明,关联研究论文DOI,概述mIDH1抑制剂处理肿瘤细胞系的转座元件分析方法(TEtranscript和SQuIRE两个分析流程)。
- 补充表格文件
- 文件名称:SupplementaryTable1_2205SQuIRE.xlsx、SupplementaryTable2_2205_TETranscripts.xlsx、SupplementaryTable3_m496_SQuIRE.xlsx、SupplementaryTable4_m496_TETtranscripts.xlsx、SupplementaryTable5_SNU1079_SQuIRE.xlsx、SupplementaryTable6_SNU1079_TETranscripts.xlsx、SupplementaryTable7_MGG152_SQuIRE.xlsx、SupplementaryTable8_MGG152_TETranscripts.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:按不同细胞系(如2205、m496、SNU1079、MGG152)和分析流程(TEtranscript、SQuIRE)分类,记录转座元件的表达量、注释信息等关键数据,支撑mIDH1抑制后转座元件激活及先天免疫信号通路的研究。
数据来源
Dryad数据库(DOI:10.5061/dryad.5mkkwh7db)
适用场景
- 肿瘤免疫机制研究: 分析mIDH1通过表观遗传抑制CGAS基因、影响先天免疫信号通路的分子机制。
- 转座元件功能分析: 探究肿瘤细胞系中转座元件的表达变化与mIDH1抑制剂的关联,及其对免疫激活的作用。
- 抗癌药物作用机制验证: 验证FDA批准的mIDH1抑制剂通过内源性逆转录酶活性激活肿瘤免疫的作用机制。
- 表观遗传学与免疫调控关联研究: 研究DNA甲基化状态对先天免疫相关基因(如CGAS)表达的调控及肿瘤免疫逃逸的关系。