数据集概述
本数据集为小麦条锈菌（Puccinia striiformis f. sp. tritici）104 E137 A-（Pst104E）菌株的端粒到端粒核相位基因组组装与注释数据，包含基因组序列、基因注释、转座元件注释及补充表格，支撑该菌株的分子生物学研究。
文件详解
- 基因组序列文件
- 文件名称：Pst104E_v3.9.asm.hapA.masked.fasta、Pst104E_v3.9.asm.hapB.masked.fasta、Pst104E_rDNA_subtypes.fasta
- 文件格式：FASTA
- 内容说明：包含Pst104E菌株的两套单倍型核基因组屏蔽序列及核糖体DNA亚型序列
- 注释文件
- 文件名称：Pst104E_v3.9.gene_anno.gff3、Pst104E_v3.9.transposable_element_anno.gff3
- 文件格式：GFF3
- 内容说明：分别为基因注释文件和转座元件注释文件，记录基因组中基因及转座元件的位置与结构信息
- 补充表格文件
- 文件名称：Supplemental_Table_S1.xlsx、Supplemental_Table_S2.xlsx、Supplemental_Table_S3.xlsx、Supplemental_Table_S4.xlsx、Supplemental_Table_S6.xlsx、Supplemental_Table_S13.xlsx等（共13个XLSX文件）
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含与该菌株基因组研究相关的补充数据表格（具体字段未披露，需参考原论文）
数据来源
论文“Long-read genomics reveal extensive nuclear-specific evolution and allele-specific expression in a dikaryotic fungus”
适用场景
- 小麦条锈菌基因组结构分析：利用端粒到端粒基因组序列研究Pst104E菌株的核基因组结构与变异特征
- 基因功能注释研究：通过基因注释文件分析该菌株的基因组成、功能分类及表达调控机制
- 转座元件进化分析：基于转座元件注释数据探究其在基因组中的分布、多样性及进化历史
- 核糖体DNA亚型研究：利用rDNA亚型序列分析该菌株核糖体DNA的遗传多样性与功能分化
- 分子植物病理学研究：为小麦条锈菌的致病机制、宿主互作及抗病育种靶标筛选提供基因组学基础数据
