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标签: GFF3

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  • Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据

    2026年1月15日 30 82 18

    数据集概述 本数据集包含喜树(Camptotheca acuminata)的高质量从头基因组组装及相关注释数据,喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等,共15个文件,为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Pyrenophora_teres_hybrid_WAC10721基因组数据_2021

    2026年1月14日 30 35 21

    数据集概述 本数据集包含Pyrenophora teres hybrid WAC10721的基因组注释、蛋白质功能预测、与参考基因组的直系同源基因分析,以及重复序列、分泌蛋白、效应子和次生代谢物等相关数据,共4个文件,支持真菌基因组学研究。 文件详解 文件名称:Orthologous analysis of P teres...
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  • Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据

    2026年1月13日 30 158 33

    数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据,包含两种鸟类(马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡)的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据,以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件,用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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  • Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集

    2026年1月13日 30 18 11

    数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据,包含10个不同类型的基因组相关文件,覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容,用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称:genome.fa 文件格式:FA...
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  • Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版

    2026年1月12日 30 38 0

    数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜(Melanaphis sacchari)的染色体级别基因组组装与注释数据,包含356.1 Mb基因组序列(其中85.5%位于3条常染色体和X染色体)、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因(BUSCO完整性达95.8%),以及系统发育分析相关信息,为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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  • Alternaria_alternata_bZIP_Based_链格孢菌转录因子胁迫响应与致病机制研究数据

    2025年12月30日 30 202 69

    数据集概述 本数据集围绕链格孢菌(Alternaria alternata)中bZIP转录因子展开,包含该真菌的基因组序列、基因注释及代谢通路分析文件,覆盖基因功能、KEGG通路、GO注释等信息,为研究其在胁迫响应与致病过程中的作用提供基础数据支撑。 文件详解 基因组序列文件...
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  • RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415

    2025年12月23日 30 112 38

    数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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  • Xff_Temecula1菌株基因组Bakta重注释数据集

    2025年12月20日 30 63 20

    数据集概述 本数据集是使用Bakta流程对Xff菌株Temecula1(NCBI登录号GCF_000007245.1)基因组进行的重注释结果,包含基因组序列、注释信息、统计摘要等多种格式文件,为研究该菌株的基因组结构与功能提供支持。 文件详解 该数据集包含十四种不同格式的文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: -...
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  • 摩洛哥阿甘树端粒到端粒分相基因组注释数据集2025

    2025年12月18日 30 148 107

    数据集概述 本数据集为摩洛哥阿甘树(Argania spinosa)的分相端粒到端粒(T2T)染色体级基因组组装提供完整注释支持,包含两个全分相单倍型的结构基因注释、预测蛋白序列及重复序列注释文件,助力该生态与经济重要树种的遗传研究。 文件详解...
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  • 基因组注释Maker工作流数据集

    2025年12月18日 30 82 79

    数据集概述 本数据集包含基因组注释Maker工作流的输入与输出文件,涵盖注释结果、统计摘要、可视化图表等多类型文件,为基因组注释研究提供完整数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件,具体说明如下: - 核心注释结果文件: - Maker_final_annotation.gff3:GFF3格式,基因组最终注释结果 -...
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  • 球形棕囊藻群体基因表达数据集

    2025年12月14日 30 185 56

    数据集概述 本数据集包含球形棕囊藻群体与单体形态的基因表达差异研究数据,涵盖转录组组装、基因表达定量及差异分析结果,支持该藻群体形成的资源消耗型防御功能研究。 文件详解 转录组组装文件:...
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  • 被子植物质体来源核DNA进化机制数据集

    2025年12月10日 30 12 1

    数据集概述 该数据集包含被子植物(开花植物)核DNA进化机制研究相关的基因组结构注释文件,覆盖三十种被子植物物种的核基因组非结构基因空间(转座元件与RNA基因)的统一重注释数据,为探究质体来源核DNA进化的偶发与持续机制提供支持。 文件详解 文件名称: Genome_structural_reannotation.zip 文件格式: ZIP压缩包...
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  • 桃蚜_Myzus_persicae_唾液蛋白质组数据集

    2025年12月11日 0 206 43

    数据集概述 本数据集包含桃蚜(Myzus persicae)唾液蛋白质组的高质量数据,通过纳米液相色谱-串联质谱(nanoLC-MS/MS)分析结合更新的基因组注释生成。数据来自约一万头桃蚜的唾液样本,涵盖肽段鉴定、蛋白质分组及基因模型关联等信息,为研究植物-昆虫互作分子机制提供支持。 文件详解 核心数据文件:...
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  • 无脊椎动物进化组蛋白染色质调控工具数据集

    2025年12月10日 30 35 0

    数据集概述 本数据集包含无脊椎动物进化研究中组蛋白染色质调控的补充数据与代码,涉及基因组注释、组蛋白基因挖掘、表达分析等内容,支持对进化机制的深入研究。 文件详解...
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  • Maker_Based_Eukaryotic_Genome_注释完整数据

    2025年12月10日 30 183 72

    数据集概述 本数据集包含使用Maker工具进行真核生物基因组注释的输入与输出数据,涵盖基因组序列、注释结果、统计报告及训练模型等23个文件,为基因组功能注释研究提供完整数据支持。 文件详解 该数据集由多种类型文件组成,具体说明如下: - 基因组序列与注释文件: - genome.fasta:FASTA格式,基因组原始序列文件 -...
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  • 中国春小麦端粒到端粒全基因组数据集CS_IAAS_v1_1

    2025年12月9日 30 24 19

    数据集概述 本数据集提供了六倍体小麦品种中国春的端粒到端粒(T2T)无间隙参考基因组CS-IAAS_v1.1,包含145.1亿碱基对,覆盖21个着丝粒和42个端粒,为研究小麦基因组演化、转录组及蛋白质组提供基础数据。 文件详解 基因组序列文件: CS-IAAS_v1.1.zip:压缩格式,包含中国春小麦全基因组序列数据 基因注释文件: CS-...
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  • 小立碗藓SMG1基因缺失对质量控制通路影响研究数据集

    2025年12月9日 30 15 7

    数据集概述 本数据集基于RNA-seq和机器学习方法,研究小立碗藓(Physcomitrella patens)中SMG1基因在mRNA、DNA及蛋白质质量控制通路中的作用,包含转录组分析、表型数据及相关代码文件,为植物质量控制过程研究提供数据支持。 文件详解...
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  • 日本沙壳藻基因组与宏基因组组装数据集

    2025年12月9日 30 103 102

    数据集概述 本数据集包含底栖海洋硅藻日本沙壳藻(Psammoneis japonica)的基因组组装及相关数据,围绕其细菌关联、重复序列驱动的基因组大小进化等研究主题构建,为硅藻基因组学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT(.txt) 内容:存储数据集的完整文件列表及描述,为使用者提供文件说明指引...
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  • Hypsibius_dujardini基因组水平基因转移研究数据集

    2025年12月6日 30 202 194

    数据集概述 本数据集为关于缓步动物Hypsibius dujardini基因组水平基因转移(HGT)研究的配套数据,包含基因组组装、注释、RNA测序、系统发育分析及补充文件等,用于验证该物种是否存在大量功能性水平基因转移,修正此前研究结论。 文件详解 核心数据文件:...
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  • 西瓜尾孢菌基因组序列数据集

    2025年11月29日 30 127 68

    数据集概述 本数据集包含西瓜尾孢菌(Cercospora citrullina)的基因组序列及相关分析文件。该真菌是导致葫芦科植物叶斑病的重要病原菌,数据集通过Illumina HiSeq 2500平台测序构建了其基因组草图,包含一百八十九个contigs,N50值为三万八千五百九十二bp,预测了八千八百五十六个基因,为后续群体基因组学研究提供资源。...
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