数据集概述
本数据集为海星消瘦病（AIWS）的比较基因组尸检研究数据，包含赭色海星（P. ochraceus）的首个基因组及注释，以及不同体型、组织类型、症状状态个体的差异基因表达分析，还整合了幸存者核苷酸多态性、温度处理差异表达及跨物种消瘦相关基因数据，用于探究消瘦病的候选基因机制。
文件详解
- 文件名称：CommentedBioinformaticsCode.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含带注释的生物信息学代码文档，用于支撑海星消瘦病基因组分析的相关计算流程与方法实现。
- 文件名称：augustus.hints.gff3
- 文件格式：GFF3
- 字段映射介绍：采用GFF3格式的基因组注释文件，由Augustus工具生成，包含基因结构预测的相关提示信息，用于描述赭色海星基因组的基因注释结果。
数据来源
论文“An initial comparative genomic autopsy of wasting disease in sea stars”
适用场景
- 海洋疾病分子机制研究: 分析海星消瘦病相关的候选基因，探究环境驱动因素与个体内在差异的关联机制。
- 海星基因组注释研究: 基于赭色海星的首个基因组及注释数据，开展海洋无脊椎动物基因组结构与功能分析。
- 差异基因表达分析: 研究不同体型、组织类型、症状状态海星的基因表达差异，挖掘消瘦病关键调控基因。
- 跨物种比较基因组学: 对比赭色海星与向日葵海星（Pycnopodia helianthoides）的消瘦相关基因，揭示无脊椎动物免疫与防御机制的保守性。
