找到92个数据集

标签: 基因组注释

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  • 鹅掌楸属物种的基因组资源数据

    2026年2月12日 30 13 2

    数据集概述 本数据集提供Podospora anserina物种复合体的基因组资源,包含该复合体剩余4个物种的染色体水平注释组装,以及共28个Podospora基因组的注释组装综合数据集。Podospora anserina是分子生物学、衰老等研究的模式生物,数据集为相关领域研究提供高质量基因组参考。 文件详解 文件名称:README.md...
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  • 内生真菌_Genome_野生生菜内生真菌基因组序列数据

    2026年2月9日 30 200 134

    数据集概述 本数据集包含从栽培生菜的野生近缘种——野莴苣(Lactuca serriola)中分离出的5种内生真菌的基因组序列数据,共6个文件,主要为基因组注释文件和补充文档,可用于植物内生真菌的基因组学研究。 文件详解 基因组注释文件(.gff格式,共5个)...
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  • Pseudomonas_sp_KK18_基因组注释文件数据集

    2026年1月29日 30 47 24

    数据集概述 本数据集包含假单胞菌属菌株Pseudomonas sp. KK18的基因组注释相关文件,涵盖抗生物合成基因簇、原核生物基因组注释、快速注释子系统技术及功能注释等不同类型的注释结果,总计4个文件,支持微生物基因组功能分析与基因挖掘研究。 文件详解 抗生物合成基因簇注释文件 文件名称:Pseudomonas sp....
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  • Tectona_grandis_Based_柚木染色体级基因组组装与萜类合成基因数据

    2026年2月9日 0 202 48

    数据集概述 本数据集提供柚木(Tectona grandis)染色体级高质量基因组组装及功能注释数据,包含基因序列、表达矩阵、基因组注释文件等,支持研究柚木串联基因复制机制及天然产物生物合成通路相关基因的发现,助力柚木品种改良与可持续生产研究。 文件详解 文档类文件 文件名称:2018.10.23-teak-data-readme.docx...
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  • AIWS_Based_海星消瘦病比较基因组分析数据

    2026年1月31日 30 14 1

    数据集概述 本数据集为海星消瘦病(AIWS)的比较基因组尸检研究数据,包含赭色海星(P. ochraceus)的首个基因组及注释,以及不同体型、组织类型、症状状态个体的差异基因表达分析,还整合了幸存者核苷酸多态性、温度处理差异表达及跨物种消瘦相关基因数据,用于探究消瘦病的候选基因机制。 文件详解...
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  • M_phalerata_Based分子序列与注释完整数据

    2026年1月30日 30 85 9

    数据集概述 本数据集包含M. phalerata的蛋白质、CDS、基因、注释及重复序列等分子生物学数据,共七个文件。数据覆盖该物种的核心分子序列资源与功能注释信息,是开展其基因组学、转录组学及功能基因研究的基础数据支撑。 文件详解 文件名称:MM_xdfigixg.emapper.annotations.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Oatk_Based植物细胞器基因组从头组装工具配套数据

    2026年1月30日 30 140 99

    数据集概述 本数据集包含195个植物细胞器基因组组装数据,涵盖24种单子叶植物、154种真双子叶植物、16种苔藓和1种苔类。数据由Sanger Institute的生命之树项目(主要来自达尔文生命之树项目)生成,用于支持论文“Oatk: a de novo assembly tool for complex plant organelle...
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  • Fagus_ddRAD_Based欧洲山毛榉基因组测序数据

    2026年1月30日 30 189 23

    数据集概述 本数据集包含欧洲山毛榉(Fagus sylvatica sensu lato)的ddRAD测序数据,主要来源于Stacks分析得到的SNPs数据及配套信息,包含基因型数据、注释文件、覆盖度表格、种群数据等8个文件,用于植物基因组学相关研究。 文件详解 基因型数据文件 文件名称:genotypes.7z、genotypes_exons-...
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  • Pisum_sativum_Based豌豆基因组转录因子数据集

    2026年1月28日 30 17 3

    数据集概述 本数据集包含豌豆(Pisum sativum)基因组中的转录因子(TF)信息,分为两个表格:Table 1记录1807个转录因子的家族预测及与蒺藜苜蓿、拟南芥的BlastP比对结果;Table 2整理豌豆、蒺藜苜蓿和拟南芥转录因子的基因标识、家族预测及描述。数据来自PlantTFDB和对应基因组注释,共1个文件。 文件详解...
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  • Annotated_cable_bacteria_基因组注释数据

    2026年1月28日 30 11 6

    数据集概述 本数据集包含使用Prokka 1.14.5版本注释的Candidatus Electrothrix和Candidatus Electronema电缆细菌基因组数据,以及这些基因组的平均氨基酸一致性(AAI)和平均核苷酸一致性(ANI)表格,共3个文件。 文件详解 AAI.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • gapseq_Based_124种原养型细菌基因组代谢网络重建数据

    2026年1月27日 30 133 87

    数据集概述 本数据集包含124种可自养合成20种蛋白质氨基酸的细菌基因组的gapseq代谢网络重建结果,通过反应与通路预测、转运体预测、草稿网络构建、培养基预测及间隙填充等流程生成,因3个基因组在NCBI不可用未纳入,共1个压缩文件。 文件详解 文件名称:Gapseq_models.zip 文件格式:ZIP...
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  • ScISOr_Seq_Based三刺鱼单细胞测序基因组注释优化数据

    2026年1月27日 30 200 55

    数据集概述 本数据集为单细胞Iso-Seq技术优化基因组注释的补充数据,包含通过ScISOr-Seq技术生成的三刺鱼基因模型注释文件、CellRanger输出信息、Iso-Seq处理数据等,可提升scRNAseq分析中基因计数完整性与细胞类型识别准确性,支持基因组注释优化研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Zymoseptoria_Based_植物病原体属基因组组装与注释数据

    2026年1月26日 30 111 4

    数据集概述 本数据集包含论文“Genome compartmentalization predates species divergence in the plant pathogen genus...
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  • Mvit_genome_Based_无脊椎动物基因组序列与注释数据集

    2026年1月25日 30 135 48

    数据集概述 本数据集包含Mvit物种(推测为某种无脊椎动物)的基因组相关数据,共7个文件,涵盖基因组序列、注释信息、比较分析结果等内容,支持基因组结构分析、功能基因挖掘及进化研究。 文件详解 基因组序列文件...
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  • HMMER_Pseudomonas_syringae毒力因子识别完整数据

    2026年1月22日 30 200 112

    数据集概述 本数据集为JSON格式对象,以Pseudomonas syringae登录号为主键,包含其毒力因子HMMER匹配结果,涵盖III型分泌系统基因、III型效应子亚家族及WHOP基因等,记录蛋白质登录号、e值和NCBI注释信息,共含一个文件。 文件详解 文件名称:HMMER_hits.json 文件格式:JSON...
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  • cephalochordate_Genome_五种头索动物基因组注释数据

    2026年1月22日 30 36 14

    数据集概述 本数据集包含五种头索动物(Asymmetron lucayanum、Branchiostoma belcheri、Branchiostoma floridae、Branchiostoma japonicum、Branchiostoma...
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  • TNL_Genes_Peach_Based抗病基因家族结构与PL域研究数据

    2026年1月21日 30 156 41

    数据集概述 本数据集围绕桃(Prunus persica)中的TIR-NB-LRR(TNL)基因家族展开,重点分析其C端后LRR(PL)结构域的特征。包含桃基因组中TNL基因的预测、PL域的序列比对、系统发育树构建等相关数据,共6个文件,支持植物抗病基因功能及结构域进化研究。 文件详解 文件名称:PJ2 predictions Fgenesh.zip...
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  • C_bovis_Genome_Source_牛隐杆线虫基因组与进化分析数据

    2026年1月21日 30 198 32

    数据集概述 本数据集为论文“The genome of C. bovis”的核心数据文件,包含牛隐杆线虫(C....
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  • Phytophthora_Ab_Initio基因模型训练参数JSON数据集

    2026年1月21日 30 121 70

    数据集概述 本数据集包含二十八个JSON文件,记录疫霉属(Phytophthora)特异性基因模型训练参数,用于从头预测(ab-initio prediction)软件的训练。参数覆盖augustus、genemark等主流基因预测工具,可支持其他相关疫霉属菌株的基因预测与注释工作。 文件详解 JSON参数文件...
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  • Bourdin_Based_医院水槽机会致病菌生态动态补充表格数据2025

    2026年1月21日 30 180 64

    数据集概述 本数据集为Bourdin et al., 2025研究的补充表格,聚焦医院水槽排水系统中三种机会致病菌的生态动态,内容涵盖微生物群落结构、细菌拮抗作用、DNA定量及基因组注释等信息,共包含10个Excel文件。 文件详解 16S测序相关表格 文件名称:Table S1_16S_Barcode, Proportion of Reads,...
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