数据集概述
本数据集包含M. phalerata的蛋白质、CDS、基因、注释及重复序列等分子生物学数据,共七个文件。数据覆盖该物种的核心分子序列资源与功能注释信息,是开展其基因组学、转录组学及功能基因研究的基础数据支撑。
文件详解
- 文件名称:MM_xdfigixg.emapper.annotations.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含M. phalerata相关序列的功能注释信息,可能涵盖基因功能描述、数据库比对结果等注释内容
- 文件名称:bm.gff3
- 文件格式:GFF3
- 字段映射介绍:基因组特征注释文件,记录基因、转录本等结构在基因组上的位置及属性信息
- 文件名称:bm.gene.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:M. phalerata的基因序列文件
- 文件名称:bm.CDS.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:M. phalerata的编码序列(CDS)文件
- 文件名称:bm.cDNA.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:M. phalerata的互补DNA(cDNA)序列文件
- 文件名称:genome.repeat.out
- 文件格式:OUT
- 字段映射介绍:基因组重复序列分析结果文件,记录重复序列的类型、位置及含量等信息
- 文件名称:bm.pep.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:M. phalerata的蛋白质序列文件
适用场景
- 基因组结构分析: 利用GFF3文件解析M. phalerata基因组的基因分布与结构特征
- 功能基因研究: 通过基因、CDS及蛋白质序列文件,开展特定功能基因的克隆与功能验证
- 分子进化分析: 基于多序列文件进行M. phalerata与近缘物种的分子进化关系研究
- 重复序列特征分析: 借助重复序列结果文件,探究该物种基因组重复序列组成及分布规律
- 转录组学研究: 利用cDNA序列文件开展转录本结构分析与表达调控研究