找到114个数据集

标签: 蛋白质序列

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  • 担子菌植物细胞壁分解基因家族数据集

    2026年2月15日 30 58 10

    数据集概述 本数据集包含44个担子菌门基因组中与植物细胞壁分解相关的42个基因家族的补充表格、蛋白质序列文件、系统发育分析文件及系统发育树文件。数据用于研究不同营养策略真菌的基因组成差异,揭示其分解机制,共101个文件。 文件详解 补充表格文件...
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  • 用于功能预测项目的蛋白质结构收集数据集

    2026年2月9日 30 159 33

    数据集概述 本数据集为蛋白质结构功能预测项目的完整数据,包含来自Swiss-Prot的蛋白质序列文件及AlphaFoldDB API的查询结果文件,共2个文件,无目录层级划分,未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分。 文件详解 文件名称:swissprot_dataset_fullheader.fasta 文件格式:FASTA...
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  • 蛋白质序列功能注释数据集_生物信息学测试数据

    2026年2月9日 30 123 95

    数据集概述 本数据集包含蛋白质序列功能注释工作流测试的输入和输出文件,共5个文件,涵盖FASTA、tabular和XML三种格式,主要用于生物信息学领域的蛋白质功能注释流程验证与测试。 文件详解 输入文件 文件名称:protein_sequences.fasta 文件格式:FASTA 字段映射介绍:包含待注释的蛋白质序列基础数据 输出文件...
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  • Zelandoperla_基因组生态物种形成研究数据

    2026年2月9日 30 146 16

    数据集概述 本数据集基于基因组分析,研究无翅昆虫的生态物种形成机制,以新西兰广布的翅多态石蝇物种复合体为对象,通过约200个标本的5万余个多态遗传标记,揭示同域全翅与翅退化生态型间的广泛平行物种形成,涉及发育相关基因区域的关键作用。 文件详解 文件名称:Suppl._Fig._S1-S14_Suppl._Tables_S1-S4.docx...
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  • 补充数据_植物生命树基因组规模系统发育数据

    2026年2月1日 30 100 44

    数据集概述 本数据集为论文“Genome-Scale Phylogenetics: Inferring the Plant Tree of Life from 18,896 Discordant Gene...
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  • 青霉素PF_T2菌株基因组组装与注释_微生物基因组数据

    2026年1月30日 30 75 25

    数据集概述 本数据集为实验室培养获得的Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组组装与注释结果,包含7个相关文件。基因组组装长度35.1 Mb,BUSCO完整度97.9%,由5个支架/ contig组成,与模式标本基因组共线性,含特异性环匹阿尼酸(CPA)基因簇,是该物种优质基因组资源。 文件详解...
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  • M_phalerata_Based分子序列与注释完整数据

    2026年1月30日 30 6 2

    数据集概述 本数据集包含M. phalerata的蛋白质、CDS、基因、注释及重复序列等分子生物学数据,共七个文件。数据覆盖该物种的核心分子序列资源与功能注释信息,是开展其基因组学、转录组学及功能基因研究的基础数据支撑。 文件详解 文件名称:MM_xdfigixg.emapper.annotations.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • P2PXML_Based_抗体_抗原结合亲和力预测数据集

    2026年1月30日 30 57 28

    数据集概述 本数据集是用于抗体-抗原结合亲和力预测的综合性数据集,包含蛋白质序列与结构信息,旨在解决现有数据覆盖单一抗原变体的局限,支持开发数据驱动的预测方法。数据集规模大且具有通用性,可用于训练和验证结合亲和力预测模型,提升抗体工程效率。 文件详解 文件名称:P2PXML_dataset.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含抗体-...
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  • Nacobbus_aberrans_植物寄生线虫转录组数据

    2026年1月30日 30 49 11

    数据集概述 本数据集包含假根结线虫Nacobbus aberrans的转录组数据,涵盖其生命周期中不同寄生阶段的基因表达变化。通过RNAseq技术分析基因表达丰度,结合多基因系统发育分析、横向基因转移事件及效应因子的转录组范围分析,为研究该线虫寄生模式转换的生物学机制及植物寄生线虫 sedentary endoparasitism 进化提供遗传资源。...
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  • Automeris_io_Based_高质量基因组组装数据

    2026年1月30日 30 64 23

    数据集概述 本数据集提供了Io蛾(Automeris io)的高质量PacBio HiFi基因组组装结果,旨在支持眼斑分子发育及反捕食防御进化的研究。Io蛾因显著的后翅眼斑成为研究拟态防御的新兴模型。数据集包含基因组组装相关的结果文件、注释文件及质量评估文件,共8个文件。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • Zenodo_Based_蛋白质语言模型稀疏自编码器解释数据集

    2026年1月29日 30 89 23

    数据集概述 本数据集来自Zenodo仓库,包含用于解释蛋白质语言模型的稀疏自编码器相关数据,涵盖蛋白质序列列表、氨基酸水平注释、稀疏自编码器权重与配置、潜在特征标签对,可支持蛋白质语言模型的稀疏自编码器分析与解释研究。 文件详解 数据集文件 文件名称:astral-40-20.08.csv 文件格式:CSV 字段映射介绍:包含SCOPe...
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  • CREMSA_Based_论文补充数据集_生物信息学_2025

    2026年1月28日 30 65 18

    数据集概述 本数据集为论文“CREMSA: Compressed indexing of (ultra) large alignments”的补充数据,包含三个用于验证研究可重复性的数据集:人工生成的随机数据集、HIV1基因组多序列比对数据集和主要促进子超家族蛋白质序列比对数据集。 文件详解...
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  • AAV_Based_抗AAV人源单克隆抗体分离与序列数据_2021

    2026年1月27日 30 192 167

    数据集概述 本数据集包含从AAV血清阳性供体中分离的人源单克隆抗体相关数据,通过单B细胞克隆技术获取,涉及抗体DNA及蛋白质序列信息,旨在研究AAV与免疫系统的相互作用,为设计可逃避中和抗体的新一代AAV载体提供支持,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:AUTHOR_DATASET_Readme_FINAL.txt 文件格式:TXT...
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  • 果蝇_Drosophila_新发现的山地物种转录组组装数据_2014年

    2026年1月26日 30 137 120

    数据集概述 本数据集为Drosophila nigrosparsa(一种欧洲山地特化果蝇)的转录组从头组装数据,基于22个发育和生理阶段的混合mRNA样本,通过Illumina高通量测序获得。数据包含组装的转录本、注释的单基因、蛋白质序列及分析脚本,可用于研究该山地物种的基因表达与适应性进化。 文件详解 组装与注释文件(共4个FASTA格式文件)...
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  • Penstemon_MAKER2_Based基因预测注释与标记开发数据

    2026年1月26日 30 117 51

    数据集概述 本数据集是针对北美特有植物Penstemon属的基因预测与注释结果,通过MAKER2注释流程从6个极低覆盖度(约0.005×−0.007×)基因组中识别基因区域,支持系统发育标记开发。包含基因注释文件、序列文件等5个文件,可用于下游引物设计及序列分化分析。 文件详解 文件名称:Penstemon-MAKER-FuncAnnots.xlsx...
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  • Oulactis_sp_Based斑点海葵触手转录组与毒液蛋白分析数据

    2026年1月26日 30 74 41

    数据集概述 本数据集针对澳大利亚斑点海葵(Oulactis sp.,尚未正式描述)触手的转录组和蛋白质组分析结果。旨在挖掘海葵触手中与毒液相关的新型肽和蛋白质序列,为其结构、功能及进化研究提供支持,助力潜在治疗用途序列的筛选。数据集含6个文件,无目录结构。 文件详解 转录本定量文件(quant.sf) 文件名称:Data File 1 -...
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  • Mvit_genome_Based_无脊椎动物基因组序列与注释数据集

    2026年1月25日 30 189 10

    数据集概述 本数据集包含Mvit物种(推测为某种无脊椎动物)的基因组相关数据,共7个文件,涵盖基因组序列、注释信息、比较分析结果等内容,支持基因组结构分析、功能基因挖掘及进化研究。 文件详解 基因组序列文件...
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  • Cytospora_Based_杏仁桃树溃疡病病原菌基因组测序与分析数据

    2026年1月22日 30 66 15

    数据集概述 本数据集包含与杏仁和桃树溃疡病相关的Cytospora sorbicola和Cytospora plurivora菌株的基因组测序及分析数据,涵盖基因组组装序列、蛋白质序列及推定效应因子表格,共9个文件,用于植物病原菌的基因组学研究。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Machine_Learning_Based_牛肠激酶变体酶活性预测数据

    2026年1月22日 30 133 53

    数据集概述 本数据集包含用于机器学习预测牛肠激酶变体酶活性的原始数据及生成特征,整合了蛋白质结构、序列和动力学信息,支持蛋白质工程AI研究。共包含两个文件,均为XLSX格式。 文件详解 文件名称:Table_S1.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含与蛋白质结构、序列或动力学相关的原始数据或特征...
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  • C_bovis_Genome_Source_牛隐杆线虫基因组与进化分析数据

    2026年1月21日 30 202 82

    数据集概述 本数据集为论文“The genome of C. bovis”的核心数据文件,包含牛隐杆线虫(C....
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