数据集概述
本数据集包含与杏仁和桃树溃疡病相关的Cytospora sorbicola和Cytospora plurivora菌株的基因组测序及分析数据,涵盖基因组组装序列、蛋白质序列及推定效应因子表格,共9个文件,用于植物病原菌的基因组学研究。
文件详解
- 基因组组装文件
- 文件名称:KARE228.ASSEMBLY.fa、KARE59.ASSEMBLY.fa、KARE79.ASSEMBLY.fa、KARE80.ASSEMBLY.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:包含Cytospora菌株的基因组组装序列
- 蛋白质序列文件
- 文件名称:KARE59.protein.faa、KARE79.protein.faa、KARE80.protein.faa、KARE228.protein.faa
- 文件格式:FAA
- 字段映射介绍:包含Cytospora菌株的预测蛋白质序列
- 推定效应因子表格
- 文件名称:Putative Effectors.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含病原菌推定效应因子的相关数据
适用场景
- 植物病原菌基因组学研究: 分析Cytospora sorbicola和Cytospora plurivora的基因组结构与功能
- 致病机制研究: 通过蛋白质序列和推定效应因子数据,探究病原菌与宿主植物的互作机制
- 植物病害防控: 为杏仁和桃树溃疡病的诊断、防治及抗病品种培育提供基因组数据支持
- 微生物分类学研究: 基于基因组序列开展Cytospora属菌株的分类与进化分析