数据集概述
本数据集为Bourdin et al., 2025研究的补充表格,聚焦医院水槽排水系统中三种机会致病菌的生态动态,内容涵盖微生物群落结构、细菌拮抗作用、DNA定量及基因组注释等信息,共包含10个Excel文件。
文件详解
- 16S测序相关表格
- 文件名称:Table S1_16S_Barcode, Proportion of Reads, ASVs Count.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含16S测序的Barcode信息、 reads占比及ASVs计数等微生物群落结构数据
- 病原体样本数据表格
- 文件名称:Table S2.A_Paeruginosa_NICU1.xlsx、Table S3.A_Smarcescens_NICU1.xlsx、Table S3.B_Smarcescens_NICU2.xlsx、Table S4.A_Smaltophilia_NICU1.xlsx、Table S4.B_Smaltophilia_NICU2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分NICU1和NICU2场景,记录铜绿假单胞菌、粘质沙雷氏菌、嗜麦芽窄食单胞菌三种机会致病菌的相关数据
- DNA定量表格
- 文件名称:Table S5_ddPCR DNA quantification.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含ddPCR技术检测的DNA定量数据
- 基因组注释表格
- 文件名称:Table S7_Genome annotations for Dt1S33 and ED4677.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录Dt1S33和ED4677菌株的基因组注释信息
数据来源
Bourdin et al., 2025研究
适用场景
- 医院环境微生物生态学研究:分析水槽排水系统中机会致病菌的生态动态规律
- 微生物群落互作分析:探究微生物群落结构对机会致病菌的影响及细菌拮抗作用机制
- 临床感染防控研究:为医院感染源追踪与防控策略制定提供数据支撑
- 微生物基因组学研究:基于基因组注释数据开展菌株功能基因分析
- 分子生物学定量研究:利用ddPCR DNA定量数据验证微生物检测方法