数据集概述
本数据集包含欧洲山毛榉（Fagus sylvatica sensu lato）的ddRAD测序数据，主要来源于Stacks分析得到的SNPs数据及配套信息，包含基因型数据、注释文件、覆盖度表格、种群数据等8个文件，用于植物基因组学相关研究。
文件详解
- 基因型数据文件
- 文件名称：genotypes.7z、genotypes_exons-only.7z
- 文件格式：.7z
- 字段映射介绍：包含全基因组基因型数据及仅外显子区域的基因型数据
- 注释与统计文件
- 文件名称：Hrivnak.genomcline.annotation.xlsx、populations.sumstats.7z、sequencing.coverage.tables.7z
- 文件格式：.xlsx、.7z
- 字段映射介绍：基因组注释信息、种群统计数据、测序覆盖度表格
- 种群数据文件
- 文件名称：popData.csv、popData.xlsx
- 文件格式：.csv、.xlsx
- 字段映射介绍：包含样本ID、编号、来源、种群信息、地理位置（经度、纬度）、国家、杂交区等字段
- 目录数据文件
- 文件名称：catalog.calls.simplified.7z
- 文件格式：.7z
- 字段映射介绍：简化的目录调用数据
适用场景
- 植物种群遗传学研究：分析欧洲山毛榉种群的遗传多样性、种群结构及基因流
- 基因组学分析：基于SNPs数据开展关联分析、选择信号检测等研究
- 生物地理学研究：结合地理位置信息探讨欧洲山毛榉的地理分布与遗传变异的关系
- 分子标记开发：利用ddRAD测序数据开发欧洲山毛榉的分子标记
- 杂交区研究：分析杂交区样本的遗传特征及杂交机制
