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MHC介导的欧洲仓鸮MHC_I等位基因分离与遗传结构数据
2026年1月30日 30 73 36
数据集概述 本数据集为欧洲仓鸮MHC-I基因遗传结构研究数据,基于1267只个体(含130个家庭的590只后代)的Illumina MiSeq测序结果,通过分析家庭内等位基因分离模式,揭示MHC-I基因座的等位基因共享、连锁关系及拷贝数变异特征,为MHC适应性遗传多样性进化研究提供支撑。 文件详解 文件名称:Data_MHC-I.xlsx...
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Fagus_ddRAD_Based欧洲山毛榉基因组测序数据
2026年1月30日 30 139 77
数据集概述 本数据集包含欧洲山毛榉(Fagus sylvatica sensu lato)的ddRAD测序数据,主要来源于Stacks分析得到的SNPs数据及配套信息,包含基因型数据、注释文件、覆盖度表格、种群数据等8个文件,用于植物基因组学相关研究。 文件详解 基因型数据文件 文件名称:genotypes.7z、genotypes_exons-...
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Haloarchaea_Based_七株盐古菌基因组测序与比较分析数据
2026年1月26日 30 126 14
数据集概述 本数据集包含七株盐古菌(Haloferax和Haloarcula属)的基因组测序数据,测序覆盖度约20倍,组装后平均50个contigs。数据揭示了两属间COG功能组富集差异、DNA代谢相关基因的属特异性扩张及基因水平转移现象,为古菌生物学研究提供支持。 文件详解 文件名称:RAST_Annotations.zip 文件格式:ZIP...
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SARS_CoV_2_Based_安大略省废水样本突变频率时空结构数据
2026年1月26日 30 166 56
数据集概述 本数据集支持在研手稿,包含加拿大安大略省废水样本中SARS-CoV-2突变频率的下一代测序数据及元数据,覆盖样本和采样点信息、测序覆盖度、突变计数、可视化数据等,共10个文件,用于分析病毒突变的时空分布特征。 文件详解 sample_metadata.json 文件格式:JSON...
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Bovine_milk_microbiota_牛乳微生物群测序原始数据
2026年1月26日 30 87 26
数据集概述 本数据集为牛乳微生物群研究的测序原始数据,包含使用V1V2和V3V4引物对重复牛乳样本进行测序得到的clean reads,用于评估不同DNA提取协议在复杂样本中的应用效果,涉及三种文件类型,总计三个文件。 文件详解 压缩文件(archive_files) 文件名称:Data.zip、Datav3v4.zip 文件格式:ZIP...
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polyfreqs_Based_多倍体基因型不确定性等位基因频率估计数据
2026年1月22日 30 207 137
数据集概述 本数据集围绕多倍体群体中等位基因频率估计的基因型不确定性问题,包含相关统计模型实现及示例分析数据。数据支持通过分层贝叶斯模型处理高通量测序数据中的等位基因剂量不确定性,提供R包实现及模拟、实证分析脚本,助力多倍体群体基因组研究。 文件详解 README_for_polyfreqs-dryad.md 文件格式:MD...
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NIBSC_Gut_DNA_Reference_肠道菌群参考菌株测试数据集
2026年1月21日 30 103 55
数据集概述 本数据集以英国国家生物标准与控制研究所(NIBSC)肠道群落标准的20种细菌复制子为参考,包含菌株物种、培养编号、基因组登录号、组装状态及两种混合样本的测序覆盖度数据,配套原始测序数据及说明文档,可用于肠道菌群测序方法验证与标准化研究。 文件详解 README.md(文档文件) 文件格式:MD...
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BearUCE_Based_北极熊棕熊黑熊基因组分子系统发育与SNP变异数据
2026年1月20日 30 67 10
数据集概述 本数据集基于基因组测序数据,分析北极熊、棕熊和黑熊的分子系统发育关系及SNP变异,平均测序覆盖度25X,鉴定出1380万个SNP,通过UCE序列分析构建系统发育树,还包含336只熊的162个SNP位点基因型数据,共2个文件。 文件详解 BearUCE_with_PartitionsRob.nex 文件格式:NEX...
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iRBD_PD_GWAS_Based_BST1和LAMP3基因关联研究补充数据
2026年1月20日 30 9 4
数据集概述 本数据集为iRBD(孤立性快速眼动睡眠行为障碍)与PD(帕金森病)相关基因关联研究的补充数据,包含1039名iRBD患者和1852名对照者的基因测序分析结果,重点探究BST1和LAMP3基因罕见变异与iRBD的关联,共涉及7个补充表格文件。 文件详解...
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JAMA_Supplemental_Data_急性髓系白血病诱导治疗后突变清除与预后关联研究数据2015
2026年1月1日 30 165 101
数据集概述 本数据集为JAMA 2015年发表的《急性髓系白血病诱导治疗后突变清除与预后的关联》论文的补充数据,包含16个文件,涵盖临床特征、基因突变、基因表达、甲基化差异、测序覆盖度等多维度信息,支持对急性髓系白血病患者诱导治疗后突变清除与预后关系的深入分析。 文件详解 临床特征文件...
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MBMG_Supplementary_昆虫人工混合物物种相对丰度估计数据_2020
2026年1月15日 30 42 7
数据集概述 本数据集为论文补充材料7,记录了利用低覆盖度鸟枪法宏基因组学技术,对昆虫人工混合物中物种相对丰度进行估计的相关数据。数据以Excel表格形式呈现,支持宏基因组学在物种丰度分析领域的研究验证与方法应用。 文件详解 文件名称:oo_378054.xlsx 文件格式:XLSX...
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Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集
2026年1月13日 30 195 88
数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据,包含10个不同类型的基因组相关文件,覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容,用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称:genome.fa 文件格式:FA...
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RAD_seq系统发育学缺失数据误解研究数据集_开花植物案例
2025年12月20日 30 68 2
数据集概述 本数据集围绕RAD-seq系统发育学中的缺失数据误解展开,分析10个RAD-seq数据集的缺失数据分布,通过模拟区分突变干扰与测序覆盖度导致的缺失模式,并以开花植物荚蒾属为实证案例,探讨测序深度对系统发育信息的影响,提供实用建议。 文件详解 数据文件:...
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近缘物种进化关系全基因组测序分析数据集
2025年12月20日 30 69 0
数据集概述 本数据集基于全基因组测序数据,探究四种黑白色鹟科鸟类的进化关系。通过分析基因树拓扑结构、基因组范围内的基因树不一致模式及基因流证据,结合多种物种树重建方法,为解决近缘物种系统发育难题提供数据支持。 文件详解 支持信息文档(PDF格式): Supporting Information_Tables S2-S4_Figures...
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矾根属系统发育基因组冲突数据集
2025年12月13日 30 77 64
数据集概述 本数据集围绕矾根属(Heuchera)的系统发育基因组冲突展开,整合了核基因、质体和线粒体三类独立基因组数据,通过多种分析策略揭示物种杂交导致的系统发育不一致现象,为植物进化研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含53个文件,涵盖多种格式,具体说明如下: - 附录与统计文件: - Appendix1_Coverage...



