Pomacea_De_novo_assembly福寿螺转录组分子生态应用数据

数据集概述

本数据集为入侵物种福寿螺的转录组从头组装数据,包含128,436条unigenes(平均长度419bp)、2,439个含转座元件的unigenes、3,196个微卫星位点、15,412个ORF单核苷酸多态性(SNPs)及878个幼螺蛋白质组数据,支持入侵物种分子生态研究。

文件详解

  • 文件名称:Pomacea_SNP.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含福寿螺转录组ORF区域检测到的15,412个单核苷酸多态性(SNPs)信息
  • 文件名称:Additional File 2.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:补充数据表,具体内容未提供预览
  • 文件名称:Pomacea_proteins.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:福寿螺幼螺蛋白质组LC-MS/MS分析鉴定的878个蛋白质序列
  • 文件名称:Pomacea_unigenes.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:福寿螺转录组从头组装得到的128,436条unigenes序列(平均长度419bp)
  • 文件名称:Additional File 1.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:补充数据表,具体内容未提供预览

数据来源

论文“De novo assembly of the transcriptome of an invasive snail and its multiple ecological applications”

适用场景

  • 入侵物种分子机制研究:分析福寿螺对环境胁迫的分子响应,评估其入侵能力与扩散潜力
  • 遗传多态性标记开发:利用微卫星和SNP位点重建福寿螺的入侵路径
  • 蛋白质组学分析:研究幼螺应激相关蛋白质的功能与表达模式
  • 转录组资源应用:为非模式入侵生物的基因组资源开发提供参考,支持分子生态学研究
  • 物种适应性评估:通过转座元件分析探究福寿螺遗传变异与环境适应的关系
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 61.01 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。