数据集概述
本数据集为入侵物种福寿螺的转录组从头组装数据,包含128,436条unigenes(平均长度419bp)、2,439个含转座元件的unigenes、3,196个微卫星位点、15,412个ORF单核苷酸多态性(SNPs)及878个幼螺蛋白质组数据,支持入侵物种分子生态研究。
文件详解
- 文件名称:Pomacea_SNP.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含福寿螺转录组ORF区域检测到的15,412个单核苷酸多态性(SNPs)信息
- 文件名称:Additional File 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:补充数据表,具体内容未提供预览
- 文件名称:Pomacea_proteins.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:福寿螺幼螺蛋白质组LC-MS/MS分析鉴定的878个蛋白质序列
- 文件名称:Pomacea_unigenes.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:福寿螺转录组从头组装得到的128,436条unigenes序列(平均长度419bp)
- 文件名称:Additional File 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:补充数据表,具体内容未提供预览
数据来源
论文“De novo assembly of the transcriptome of an invasive snail and its multiple ecological applications”
适用场景
- 入侵物种分子机制研究:分析福寿螺对环境胁迫的分子响应,评估其入侵能力与扩散潜力
- 遗传多态性标记开发:利用微卫星和SNP位点重建福寿螺的入侵路径
- 蛋白质组学分析:研究幼螺应激相关蛋白质的功能与表达模式
- 转录组资源应用:为非模式入侵生物的基因组资源开发提供参考,支持分子生态学研究
- 物种适应性评估:通过转座元件分析探究福寿螺遗传变异与环境适应的关系