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水稻转录组中病毒多样性的深度分析数据集
2026年2月9日 30 209 121
数据集概述 本数据集基于17,115个水稻转录组RNA-seq文库，覆盖24个稻属物种及51个国家样本，通过从头组装和同源性方法鉴定出810个完整或近完整病毒，包括276种已知病毒和534种新型病毒。数据还包含病毒分类注释及与水稻密切相关的427种病毒筛选结果，为水稻病毒病防控提供新见解。 文件详解 压缩文件（Archive files）...
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油茶种子成熟自然干燥转录组比较分析数据
2026年2月9日 30 73 7
数据集概述 本数据集基于油茶种子成熟自然干燥过程的转录组比较分析研究，包含5个水分含量水平下的转录组数据，涉及普通油茶和小果油茶两个物种。数据聚焦脂质代谢相关基因，通过从头组装获得111,156个unigenes，识别出244个参与脂肪酸合成与积累的基因，为揭示种子干燥过程中脂质代谢分子机制提供支持。 文件详解 文件名称：sequence of...
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千花藤的核基因系谱研究_中美洲云雾林的植物分类学分析
2026年1月31日 30 40 10
数据集概述 本数据集为墨西哥手树（Chiranthodendron pentadactylon）的核系统地理学研究数据，包含基于RAD测序的核DNA序列分析及生态位建模结果，涉及墨西哥和危地马拉种群的遗传结构、分化时间、 demographic趋势等信息，支持对该物种第四纪演化历史及云林片段化影响的研究。 文件详解...
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Oatk_Based植物细胞器基因组从头组装工具配套数据
2026年1月30日 30 77 72
数据集概述 本数据集包含195个植物细胞器基因组组装数据，涵盖24种单子叶植物、154种真双子叶植物、16种苔藓和1种苔类。数据由Sanger Institute的生命之树项目（主要来自达尔文生命之树项目）生成，用于支持论文“Oatk: a de novo assembly tool for complex plant organelle...
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LMAS_Source_微生物群落组装软件基准测试补充材料
2026年1月30日 30 145 58
数据集概述 本数据集为LMAS（自动化工作流程）的补充材料，包含用于基准测试传统及宏基因组原核生物从头组装软件的模拟数据与参考基因组信息。以ZymoBIOMICS微生物群落标准的8个细菌基因组和4个质粒（三重形式）为参考，通过inSilicoSeq生成带或不带错误的均匀分布模拟原始序列数据，共31个文件。 文件详解 表格文件（Tables）...
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Evaluation_蜘蛛RNA保存方法对转录组组装影响评估数据
2026年1月28日 30 60 0
数据集概述 本数据集为蜘蛛RNA保存方法对从头转录组组装影响的评估研究数据，包含3个文件。研究针对野外采集蜘蛛样本，测试不同温度、防腐剂及样本浸没状态对RNA质量及转录组组装结果的影响，为非模式生物（如蜘蛛）的野外样本保存提供指导。 文件详解 文件名称：18S_all_comp.fasta 文件格式：FASTA...
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RNA_seq_Based_转录组组装与差异表达量化策略评估数据
2026年1月28日 30 60 2
数据集概述 本数据集为RNA-seq实验转录组组装与差异表达量化的模拟评估数据，包含16个文件，涵盖脚本、代码及压缩包。用于探究转录组特征、技术处理及生物信息学流程对转录组质量和差异表达推断的影响，为RNA-seq实验设计与分析提供方法学参考。 文件详解 代码脚本文件...
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芦笋目转座子元件低覆盖度基因组序列组装与比较分析数据_2013年
2026年1月28日 30 111 43
数据集概述 本数据集针对天门冬目（含洋葱、芦笋、龙舌兰等）11个代表性类群的低覆盖度单端Illumina数据，通过从头组装获得转座元件contig，结合单子叶重复序列参考库注释，估算核基因组中转座元件的相对比例，用于分析该类群转座元件演化模式。 文件详解 README_for_Asparagales.txt 文件格式：TXT...
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Tigriopus_Based加州哲水蚤异域进化转录组分化研究数据
2026年1月27日 30 80 4
数据集概述 本数据集围绕海洋桡足类加州哲水蚤（Tigriopus californicus）的异域进化展开，包含转录组全基因组分化与多态性的分析数据。通过对不同分化阶段的种群进行比较，探究非适应性过程（如遗传漂变）与适应性进化对基因组分化模式的影响，揭示进化在基因层面的可预测性。数据集含16个文件，涵盖说明文档与压缩包两类。 文件详解...
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epiGBS2_Based_浮萍克隆系DNA甲基化与环境暴露研究数据
2026年1月25日 30 36 0
数据集概述 本数据集包含浮萍（Lemna minor L.）克隆系的原始表型数据及DNA甲基化中间数据，对应论文“DNA methylation in clonal Duckweed lineages (Lemna minor L.) reflects current and historical environmental...
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果蝇_Drosophila_新发现的山地物种转录组组装数据_2014年
2026年1月26日 30 133 64
数据集概述 本数据集为Drosophila nigrosparsa（一种欧洲山地特化果蝇）的转录组从头组装数据，基于22个发育和生理阶段的混合mRNA样本，通过Illumina高通量测序获得。数据包含组装的转录本、注释的单基因、蛋白质序列及分析脚本，可用于研究该山地物种的基因表达与适应性进化。 文件详解 组装与注释文件（共4个FASTA格式文件）...
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Gryllus_rubens_Based_生命周期转录组从头组装与表达谱数据
2026年1月20日 30 58 54
数据集概述 本数据集为直翅目昆虫Gryllus rubens（蟋蟀）的生命周期转录组资源，包含7个发育阶段的RNA-seq数据从头组装结果，涉及27,312条转录本的注释与表达谱分析，涵盖胚胎、若虫至成虫阶段的基因表达模式，是首个覆盖该物种完整个体发育的转录组数据。 文件详解 注释转录组文件...
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Hucho_taimen_Based_哲罗鲑转录组从头组装与特征分析数据
2026年1月21日 30 107 10
数据集概述 本数据集为哲罗鲑（Hucho taimen）的转录组从头组装与特征分析结果，包含转录组序列、功能注释、基因家族分析、正选择基因鉴定及微卫星标记等数据，共11个压缩文件，可用于研究该濒危物种的保护遗传学、系统发育及进化机制。 文件详解 文件名称：Index_and_primers_for_genotype.zip 文件格式：ZIP...
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SNP_Genotyping_基于双酶切RAD测序的基因分型错误率研究数据
2026年1月21日 30 167 165
数据集概述 本数据集围绕非模式生物SNP基因分型错误率展开，通过双酶切RAD测序技术，以霍夫曼二趾树懒母子对为研究对象，分析覆盖度与序列质量对参考比对及从头组装数据集基因分型错误率的影响，同时评估错误率对亲子关系鉴定的作用，为测序方案设计提供参考。 文件详解 README_for_SNP_datasets.txt 文件格式：TXT...
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Pitcairnia_spp_转录组_凤梨科植物_基因注释_分子生物学数据
2026年1月21日 30 76 32
数据集概述 本数据集包含两种杂交凤梨科植物（Pitcairnia属）的叶片和花转录组数据，涵盖从头组装结果、功能注释信息及候选基因分析。数据识别了与传粉者吸引、生殖隔离相关的候选基因，涉及类黄酮和花青素生物合成途径的关键酶及转录因子，还提供了微卫星位点信息，为研究植物适应性分化与生殖隔离分子机制提供资源。 文件详解 表格文件 文件名称：Table...
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Arbacia_lixula_Based_地中海海胆组织转录组与基因表达数据
2026年1月20日 30 112 11
数据集概述 本数据集为地中海生态关键物种Arbacia lixula的转录组与基因表达数据，包含体组织（体腔细胞、消化组织）和生殖组织（卵巢、睾丸）的转录组测序结果，以及从头组装的参考转录组和差异表达分析结果，共186084条转录本，可用于研究该物种的组织特异性基因表达及进化适应机制。 文件详解 Arbacia...
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Polygonia_c_album_Based_多食性蝴蝶幼虫转录组研究数据
2026年1月20日 30 62 60
数据集概述 本数据集为多食性蝴蝶瑞典comma（Polygonia c-album）幼虫的转录组研究数据，通过RNA-Seq技术分析其在不同寄主植物（荨麻、醋栗）及不同龄期（2龄、4龄）下的基因表达模式，探究其多食性可塑性的分子机制，包含转录组组装序列及基因表达数据。 文件详解 README文档 文件名称：README_for_P. c-album...
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Pomacea_De_novo_assembly福寿螺转录组分子生态应用数据
2026年1月20日 30 145 71
数据集概述 本数据集为入侵物种福寿螺的转录组从头组装数据，包含128,436条unigenes（平均长度419bp）、2,439个含转座元件的unigenes、3,196个微卫星位点、15,412个ORF单核苷酸多态性（SNPs）及878个幼螺蛋白质组数据，支持入侵物种分子生态研究。 文件详解 文件名称：Pomacea_SNP.xlsx...
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Seascape_Genetics_Based_阿拉伯半岛双带海葵鱼基因结构分析数据
2026年1月18日 30 29 9
数据集概述 本数据集基于ddRAD测序技术，分析阿拉伯半岛红海及亚丁湾双带海葵鱼（Amphiprion bicinctus）及阿曼特有种（Amphiprion omanensis）的基因结构，探究地理与环境因素对基因流的影响，包含基因数据、分析脚本及结果文件共9份，支持海洋生物基因结构与杂交模式研究。 文件详解 信息类文件...
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Ophioderma_longicauda_Based脆星生殖隔离正选择基因研究数据
2026年1月18日 30 7 3
数据集概述 本数据集为脆星隐存种复合体Ophioderma longicauda的转录组研究数据，包含产卵物种C3和孵育物种C5的基因序列及直系同源基因信息，重点分析生殖隔离相关的正选择基因，尤其是精子离子通道基因，探索生殖模式差异对遗传多样性和生殖隔离的影响。 文件详解 比对文件包 文件名称：alignments.zip 文件格式：ZIP...
