数据集概述
本数据集为脆星隐存种复合体Ophioderma longicauda的转录组研究数据，包含产卵物种C3和孵育物种C5的基因序列及直系同源基因信息，重点分析生殖隔离相关的正选择基因，尤其是精子离子通道基因，探索生殖模式差异对遗传多样性和生殖隔离的影响。
文件详解
- 比对文件包
- 文件名称：alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含C3和C5物种间直系同源基因的序列比对数据，支持正选择基因的检测分析
- 组装转录组文件包
- 文件名称：assembled_transcriptomes.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含C3（20,146个基因）和C5（22,123个基因）的从头组装转录组数据，以及12,229个直系同源基因集
数据来源
论文“Positive selection on sperm ion channels in a brooding brittle star: consequence of life-history traits evolution”
适用场景
- 生殖隔离机制研究：分析正选择基因（如精子离子通道基因NHE和TetraKCNG）在脆星生殖隔离中的作用
- 遗传多样性比较：对比产卵与孵育脆星物种的遗传多样性差异，验证繁殖策略对遗传多样性的影响
- 配子识别机制分析：研究精子-卵子化学吸引受体的物种特异性差异，探索配子识别的分子机制
- 进化适应研究：通过祖先序列重建，分析自然选择对生殖相关基因的定向作用
