数据集概述
本数据集为多食性蝴蝶瑞典comma（Polygonia c-album）幼虫的转录组研究数据，通过RNA-Seq技术分析其在不同寄主植物（荨麻、醋栗）及不同龄期（2龄、4龄）下的基因表达模式，探究其多食性可塑性的分子机制，包含转录组组装序列及基因表达数据。
文件详解
- README文档
- 文件名称：README_for_P. c-album de novo TA.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明转录组组装的背景信息，包括测序数据来源（8个全幼虫组织样本的RNA-Seq数据，共8000万条100bp单端 reads）、欧洲核苷酸档案库登录号（ERP002606）及幼虫饲养条件（寄主植物与龄期分组）。
- 转录组序列文件
- 文件名称：P. c-album de novo TA.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含从头组装的转录组序列，记录contig的ID及对应的核苷酸序列信息。
- 表达数据文件（Contig水平）
- 文件名称：P. c-album TA-contig expression.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录转录组contig在不同样本中的表达量数据，样本按幼虫龄期（2龄、4龄）和寄主植物（Urtica dioica、Ribes uva-crispa）分组。
- 表达数据文件（基因水平）
- 文件名称：P. c-album whole gene expression.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录基因在不同样本中的整体表达量数据，样本分组同contig水平表达数据，用于分析基因表达的差异模式。
数据来源
论文“Mechanisms of macroevolution: polyphagous plasticity in butterfly larvae revealed by RNA-Seq”
适用场景
- 昆虫多食性分子机制研究: 分析不同寄主植物诱导的蝴蝶幼虫基因表达差异，探究多食性可塑性相关的解毒、消化基因调控模式。
- 转录组学数据分析: 利用从头组装的转录组序列及表达数据，开展基因功能注释、差异表达分析等研究。
- 昆虫发育与寄主适应研究: 比较不同龄期幼虫的基因表达模式，结合寄主植物因素，揭示发育阶段与寄主适应的关联机制。
- 进化生物学研究: 验证模式物种转录调控模式在非模式蝴蝶物种中的通用性，为宏观进化机制研究提供数据支持。
