数据集概述
本数据集记录水稻在磷酸盐饥饿及恢复条件下,全基因组亚硫酸氢盐测序分析得到的DNA甲基化(mC)时空动态变化。数据显示磷酸盐饥饿诱导的mC变化广泛存在且优先定位于高表达基因附近的转座元件(TEs),揭示转录与表观基因组变化的时间层级关系,为环境胁迫响应的表观遗传机制研究提供支撑。
文件详解
- 补充数据文件(共12个xlsx文件)
- 文件名称:以“Figure[数字]-source data [数字].xlsx”命名(例如Figure 4-source data 1.xlsx、Figure 5-source data 3.xlsx等)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:文件为研究中对应图表的源数据,内容涵盖水稻磷酸盐胁迫下DNA甲基化水平、基因表达量、转座元件甲基化位点分布等实验测量值,支撑基因转录与表观遗传变化的关联性分析。
数据来源
论文“Stress induced gene expression drives transient DNA methylation changes at adjacent repetitive elements”
适用场景
- 植物胁迫表观遗传学研究:分析水稻在磷酸盐饥饿下DNA甲基化与基因表达的时空动态关系。
- 转座元件功能研究:探究高诱导基因附近转座元件的甲基化调控机制。
- 表观遗传跨物种比较:对比水稻与拟南芥在磷酸盐胁迫下DNA甲基化响应的物种特异性。
- 环境响应分子机制分析:揭示胁迫条件下转录变化与表观基因组修饰的时间层级关联。