找到33个数据集

标签: GFF

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  • Asian_arowana_Based_三种变种染色体水平基因组组装与基因注释数据

    2026年1月18日 30 66 33

    数据集概述 本数据集包含亚洲龙鱼(Scleropages formosus)三种常见变种(金色、红色、绿色)的基因组序列与注释数据。其中金色龙鱼为染色体水平组装,红、绿龙鱼为草图组装,分别注释了22016、21256、21524个蛋白编码基因,旨在解决其生物学研究与育种种质缺乏参考基因组的问题。 文件详解...
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  • Brassica_napus_Based_甘蓝型油菜两个近缘品种基因组组装与比较数据

    2026年1月18日 30 55 10

    数据集概述 本数据集包含甘蓝型油菜品种Tapidor的从头基因组组装,以及与改良组装的Darmor-bzh品种的比较数据。两者采用相同注释方法以实现基因内容对比,识别了各品种特有基因并区分组装注释差异导致的伪影,共含17个归档文件。 文件详解 基因组组装与注释文件...
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  • Tectona_grandis_Based_柚木染色体级基因组组装与萜类合成基因数据

    2026年1月18日 0 200 32

    数据集概述 本数据集提供柚木(Tectona grandis)染色体级高质量基因组组装及功能注释数据,包含基因序列、表达矩阵、基因组注释文件等,支持研究柚木串联基因复制机制及天然产物生物合成通路相关基因的发现,助力柚木品种改良与可持续生产研究。 文件详解 文档类文件 文件名称:2018.10.23-teak-data-readme.docx...
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  • Chenopodium_quinoa_Based_藜麦光周期与发育响应转录组数据

    2026年1月15日 30 29 24

    数据集概述 本数据集记录藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)叶与茎尖分生组织在光周期和发育过程中的转录组信息,包含光周期敏感与不敏感材料的基因表达差异,涉及222个光周期响应叶基因、1812个长日条件下材料差异叶基因、57个短日条件下发育响应叶基因及911个茎尖分生组织成花转变响应基因,可用于藜麦开花时间调控机制研究。 文件详解...
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  • Camptotheca_De_novo_喜树基因组组装与抗癌化合物生物合成研究数据

    2026年1月15日 30 6 3

    数据集概述 本数据集包含喜树(Camptotheca acuminata)的高质量从头基因组组装及相关注释数据,喜树是抗癌化合物喜树碱的天然来源。数据涵盖基因组序列、基因模型、功能注释、BUSCO评估结果、基因表达矩阵及系统发育树等,共15个文件,为喜树碱生物合成途径研究及药物开发提供基础。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Beyond_Buro类发酵乳杆菌BIL20_BIL24株基因组分析数据集研究报告

    2026年1月15日 30 180 40

    数据集概述 本数据集对应论文《Beyond Buro》,包含从菲律宾传统发酵鱼制品burong isda中分离的Limosilactobacillus fermentum BIL20和BIL24菌株的基因组数据,涵盖基因组组装、RAST与Prokka注释及益生菌相关基因的定位映射,为研究其益生菌潜力提供基础,共8个文件。 文件详解...
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  • Supporting_Information_海岸海洋浮游菌海藻附生圈竞争力研究数据

    2026年1月14日 30 19 12

    数据集概述 本数据集是论文“Competitiveness of Planctomycetes inhabiting macroalgae phycosphere in coastal ocean: evidences from a representative isolate with strong ability to degrade...
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  • Siegel_Lab_Based_布氏锥虫Tb427菌株基因组组装流程数据0_0_3版

    2026年1月13日 30 2 1

    数据集概述 本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株(Tb427)的基因组组装数据,包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式(coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded),v11版本包含二倍体 scaffolded组装,所有组装文件均附带序列和注释信息。 文件详解...
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  • Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023

    2026年1月13日 30 54 23

    数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy(碳水化合物活性酶)预测结果,涉及相关菌株(如Pcopri、Btheta、Buniformis)的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码,共47个文件,用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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  • 破伤风梭菌_Clostridium_perfringens_1_2_丙二醇细胞壁研究数据

    2026年1月13日 30 204 192

    数据集概述 本数据集围绕产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)对1,2-丙二醇的利用及其与细胞包膜的相互作用展开,包含微阵列杂交后的荧光强度数据,以及实验所用的组装注释基因组文件,为研究该菌的代谢机制与细胞包膜相互作用提供基础数据支持。 文件详解 Clostridium_MM2023_5.gff 文件格式:GFF...
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  • Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版

    2026年1月12日 30 209 56

    数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜(Melanaphis sacchari)的染色体级别基因组组装与注释数据,包含356.1 Mb基因组序列(其中85.5%位于3条常染色体和X染色体)、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因(BUSCO完整性达95.8%),以及系统发育分析相关信息,为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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  • Rubioideae_Phylogenomics_Based_茜草亚科质体系统发育与核质不一致性研究数据

    2025年12月31日 30 184 46

    数据集概述 本数据集基于核基因组目标捕获测序项目的脱靶 reads 构建质体基因组系统发育树,探究茜草科茜草亚科的进化关系及核质不一致性。包含一百二十个质体基因组序列,通过公共双端 Illumina 测序数据组装得到,支持亚族内及亚族间多数关系的解析,识别出核质不一致案例,为植物系统发育研究提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • Dryad_Based_superasterid基因组深度学习NLR注释数据集v250214_91366

    2025年12月31日 30 63 6

    数据集概述 本数据集通过深度学习工具Helixer对230个高质量superasterid基因组进行标准化从头注释,结合NLRtracker识别出91,366个NLRs及相关序列。数据按APG IV系统发育目分类存储,包含基因组组装、注释文件、NLR序列及补充元数据,支持superasterid植物NLR免疫受体的比较基因组学与进化研究。 文件详解...
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  • Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据

    2025年12月30日 30 178 142

    数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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  • terranigra_dataset_Based_Fictibacillus_terranigra分析数据集

    2025年12月29日 30 155 28

    数据集概述 本数据集包含Fictibacillus terranigra的分析数据,共13个文件,涵盖基因注释、功能预测、代谢分析等内容,涉及blastKOALA、Prokka注释、microtrait筛选、dbcan3分析、DRAM及METABOLIC结果等多种类型文件,可用于研究该菌株的基因功能与代谢特征。 文件详解 基因功能注释文件...
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  • Tuber_melanosporum_Genome_Resequencing_SNP_Survey_Data

    2025年12月29日 30 194 90

    数据集概述 本数据集为佩里戈尔黑松露(Tuber melanosporum Vittad.)的全基因组单核苷酸多态性(SNP)调查数据,通过Illumina高通量重测序技术对6个地理来源的菌株基因组进行测序分析,识别出442326个核心基因组SNP,包含重复序列及编码区的SNP分布,为该真菌的群体遗传学和基因组学研究提供资源。 文件详解...
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  • 加勒比胎生石龙子Spondylurus_nitidus与S_culebrae染色体水平参考基因组数据集

    2025年12月22日 30 48 1

    数据集概述 本数据集为加勒比胎生石龙子Spondylurus nitidus和S. culebrae的高质量染色体水平参考基因组组装结果,包含基因序列、注释信息、统计文件等,支撑对这两种石龙子基因组结构与功能的研究。 文件详解 基因序列文件:...
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  • 烟草天蛾基因组从头组装数据集

    2025年12月24日 30 92 81

    数据集概述 本数据集提供烟草天蛾(Manduca sexta)的新参考基因组JHU_Msex_v1.0,通过现代技术从头组装,提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb,连续性为原版本的约25倍,scaffold N50超14 Mb,注释含25,256个基因,可供公开使用。 文件详解...
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  • 利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫跨亚属杂交支持材料数据集

    2025年12月23日 30 107 105

    数据集概述 本数据集为利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫跨亚属杂交研究的支持材料,包含基因表达计数、参考基因组及注释文件、直系同源群列表、基因分布与GO富集分析图表等,支撑寄生虫基因组兼容性与转录组适应性研究。 文件详解 基因表达计数文件: counts_on_hybrid.tsv:TSV格式,含杂交参考基因组(利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫拼接)的基因原始计数...
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  • 五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集

    2025年12月23日 0 159 144

    数据集概述 本数据集提供五桠果(Dillenia turbinata)的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目,是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对,BUSCO完整性达97%,包含36,967个蛋白编码基因模型,为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md,格式:...
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