数据集概述
本数据集对应论文《Beyond Buro》,包含从菲律宾传统发酵鱼制品burong isda中分离的Limosilactobacillus fermentum BIL20和BIL24菌株的基因组数据,涵盖基因组组装、RAST与Prokka注释及益生菌相关基因的定位映射,为研究其益生菌潜力提供基础,共8个文件。
文件详解
- .gff格式文件(4个)
- 文件名称:BIL20_WGS_ProkkaAnnotations.gff、BIL24_WGS_ProkkaAnnotations.gff、BIL20_WGS_RASTAnnotations.gff、BIL24_WGS_RASTAnnotations.gff
- 内容说明:包含菌株基因组的Prokka和RAST注释信息
- .fa格式文件(2个)
- 文件名称:BIL20_WGS_Assembly.fa、BIL24_WGS_Assembly.fa
- 内容说明:菌株的全基因组测序组装数据
- .json格式文件(2个)
- 文件名称:BIL20_WGS_ProkseeMap.json、BIL24_WGS_ProkseeMap.json
- 内容说明:菌株基因组中益生菌相关基因及其功能类别的定位映射数据
数据来源
论文“Beyond Buro”
适用场景
- 益生菌基因组学研究: 分析Limosilactobacillus fermentum BIL20和BIL24菌株的基因组结构与功能
- 发酵食品微生物资源开发: 挖掘传统发酵食品来源乳酸菌的益生菌潜力
- 菲律宾乳酸菌资源研究: 补充菲律宾发酵食品乳酸菌基因组与益生菌测试的研究数据
- 益生菌相关基因功能分析: 基于注释和映射数据探究菌株益生菌特性的分子机制