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青霉素PF_T2菌株基因组组装与注释_微生物基因组数据
2026年1月30日 30 139 109
数据集概述 本数据集为实验室培养获得的Penicillium fuscoglaucum Pf_T2菌株的基因组组装与注释结果，包含7个相关文件。基因组组装长度35.1 Mb，BUSCO完整度97.9%，由5个支架/ contig组成，与模式标本基因组共线性，含特异性环匹阿尼酸（CPA）基因簇，是该物种优质基因组资源。 文件详解...
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Mesorhizobium_Based互利共生合作动态基因组架构研究数据
2026年1月22日 30 118 60
数据集概述 本数据集聚焦Mesorhizobium野生种群中互利共生合作的动态基因组架构，通过基因组数据揭示共生基因岛存在与否的基因型差异是该种群合作性状遗传变异的重要来源，为解释互利共生在非合作突变体存在下的维持机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：PorterCooperationData.xlsx 文件格式：XLSX...
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Klebsiella_Based_克雷伯氏菌原噬菌体互作与荚膜进化研究数据
2026年1月21日 30 76 5
数据集概述 本数据集围绕克雷伯氏菌原噬菌体的丰度、感染性及噬菌体-细菌互作展开，包含35株肺炎克雷伯菌复合种菌株的诱导噬菌体-细菌互作网络数据，揭示原噬菌体裂解循环、宿主范围与荚膜血清型的模块关系，以及噬菌体捕食下荚膜丢失的进化现象，共含4个数据文件。 文件详解 数据文件（共4个）...
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AutoFixMark_Based_精选化能自养生物基因组列表及蛋白质序列数据
2026年1月19日 30 91 54
数据集概述 本数据集包含359个精选化能自养生物基因组的列表，其中347个用于AutoFixMark工具的基准测试。数据集提供了这347个基因组的蛋白质序列FASTA文件，文件来源于NCBI RefSeq和INSDC，共包含2个文件，无目录结构。 文件详解...
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CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据
2026年1月14日 30 14 7
数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射（CPR）基因组子集，内容为CPR微生物的基因组序列数据，以压缩包形式存储，可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称：jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含与Jaffe et al....
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Viral_Dark_Matter_Based_微生物基因组病毒暗物质与宿主相互作用数据
2026年1月13日 30 9 4
数据集概述 本数据集通过挖掘公共细菌和古菌基因组数据，识别出12,498个高置信度病毒基因组及其关联的微生物宿主。数据补充了现有公共数据集，提供13个新细菌门的首条病毒序列，助力解析病毒组中未知序列空间，包含病毒分类、基因组重组、原噬菌体及共感染等分析内容。 文件详解 文件名称：VirSorter_Curated_Dataset_genbank-...
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Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018
2026年1月12日 30 171 57
数据集概述 本数据集为沙门氏菌（Salmonella enterica）的cgMLST方案，2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座，用于微生物基因组分型分析，数据集以压缩包形式提供。 文件详解...
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ENA_PRJEB44986_南极稀有放线菌Barrientosiimonas_humi全基因组序列与注释数据集
2025年12月27日 30 198 34
数据集概述 本数据集为南极稀有放线菌新属新种Barrientosiimonas humi gen. nov., sp. nov. 39T的全基因组测序与注释结果源文件，包含基因组特征、功能分类、蛋白序列相似性等分析内容，共10个文件，可用于该菌株的基因组学与功能生物学研究。 文件详解 功能分类分析文件（.xlsx格式，共6个） 包含：Fig....
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菲律宾马比尼海底地下水排放区微生物垫宏基因组组装基因组数据集
2025年12月21日 30 205 26
数据集概述 该数据集包含菲律宾马比尼海底地下水排放区微生物垫中海洋微生物的宏基因组组装基因组（MAGs）及其注释信息，基于鸟枪法宏基因组学技术分析微生物多样性与功能特征，为相关微生物研究提供数据支持。 文件详解 2_2_Ac_Mat_Q30_MAGs.rar：RAR格式压缩文件，包含Q30质量过滤后的宏基因组组装基因组原始数据...
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Mgnify_Based_UHGP_v1_0_Based_系统发育数据库完整数据
2025年12月15日 30 177 82
数据集概述 该数据集为UHGP v1.0版本的系统发育数据库，来源于Mgnify基因组数据库，包含一个压缩格式的系统发育数据文件，用于存储与系统发育相关的信息。 文件详解 文件名称: phylogenize_data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 数据集仅包含一个压缩文件，未提供具体字段映射或内容预览信息。 数据来源...
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基于贝叶斯方法的侧向基因转移分析数据集
2025年12月11日 30 106 88
数据集概述 本数据集包含基于贝叶斯MCMC方法分析侧向基因转移（LGT）的研究相关数据。该方法整合基因复制、丢失、LGT及序列进化，应用于柔膜菌纲和蓝细菌的全基因组分析，为理解LGT在原核生物进化中的作用提供支持。 文件详解 文件名称: si.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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微生物基因组分型工具框架camlhmp代码与数据
2025年12月10日 30 202 76
数据集概述 本数据集包含论文《camlhmp: A simple framework for building reproducible microbial genome-based typing tools》的配套代码与数据，涵盖基因组组装下载分析代码、Bactopia结果、元数据及绘图用R代码，为微生物分型工具开发提供可复现资源。 文件详解...
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细菌与古菌功能系统预测的时空基因组分析数据集
2025年12月10日 30 54 10
数据集概述 本数据集为"细菌与古菌功能系统预测的时空基因组分析"研究的补充数据，包含多种格式的文件，涵盖基因组数据压缩包、实验数据表、研究图表、序列文件及系统发育树等，为相关基因组分析提供支持。 文件详解 该数据集包含33个文件，具体说明如下： - 压缩包文件（.tgz格式，共17个）： -...
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大肠杆菌与人类基因组Blastn比对分析数据集
2025年12月5日 30 6 4
数据集概述 本数据集记录了大肠杆菌（Ecoli U00096.2）与人类基因组（Hg38）的Blastn比对分析结果，包含两者基因组序列的相似性比对信息，涉及短片段及整体比对内容，为研究两者基因组互作及潜在疾病关联提供数据支持。 文件详解 文件名称: Ecoli Vs Human genome Hg38 Blastn short...
