Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018

数据集概述

本数据集为沙门氏菌（Salmonella enterica）的cgMLST方案，2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座，用于微生物基因组分型分析，数据集以压缩包形式提供。

文件详解

• 文件名称：SupplementaryFile3_enterobase_senterica_cgmlst_clean.zip
• 文件格式：ZIP
• 字段映射介绍：压缩包内包含沙门氏菌cgMLST方案的基因座序列文件，具体内容需解压后查看，未提供预览信息。该方案适配chewBBACA工具，包含3000个符合编码序列要求的基因座。

数据来源

论文“https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.649517”

适用场景

• 沙门氏菌基因分型分析: 用于基于cgMLST方案的沙门氏菌菌株分型、溯源及进化关系研究。
• 微生物基因组数据标准化处理: 适配chewBBACA工具，支持大规模沙门氏菌基因组数据的自动化分析。
• 传染病监测与防控: 辅助沙门氏菌感染暴发的菌株比对与传播链追踪。
• 微生物基因组学研究: 为沙门氏菌基因组结构、基因多样性及种群动态分析提供标准化基因座参考。