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标签: 编码序列

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  • Nacobbus_aberrans_植物寄生线虫转录组数据

    2026年1月30日 30 118 99

    数据集概述 本数据集包含假根结线虫Nacobbus aberrans的转录组数据，涵盖其生命周期中不同寄生阶段的基因表达变化。通过RNAseq技术分析基因表达丰度，结合多基因系统发育分析、横向基因转移事件及效应因子的转录组范围分析，为研究该线虫寄生模式转换的生物学机制及植物寄生线虫 sedentary endoparasitism 进化提供遗传资源。...
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  • Archaea_Genome_古菌基因组核心通路编码序列解构数据

    2026年1月28日 30 60 34

    数据集概述 本数据集为古菌基因组核心通路编码序列解构分析结果，包含71种古菌（覆盖不同分类类群与生理类型）的基因组数据及5条核心通路的编码序列分析文件，涉及密码子使用模式、密码子对偏好等研究内容，可用于探究古菌核心通路编码序列的组装策略与共识特征。 文件详解 压缩文件（Archive files） 文件名称：All 71 genomes 5...
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  • Aphis_nerii_Based乳草专食性昆虫宿主毒性适应转录组数据

    2026年1月26日 30 194 141

    数据集概述 本数据集围绕乳草专食性蚜虫（Aphis nerii）对不同毒性宿主植物的响应展开，包含蚜虫生活史性状（存活、繁殖力等）和全虫体基因表达数据，用于探究昆虫对植物次生代谢物的适应机制及宿主专化的进化过程，共6个文件。 文件详解 存活数据文件 文件名称：survival_total.csv 文件格式：CSV...
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  • InpactorDB_Based_LTR反转录转座子检测阴性实例原始数据

    2026年1月22日 30 91 2

    数据集概述 本数据集包含植物基因组中除LTR反转录转座子（LTR_RTs）外的其他基因组特征序列，作为机器学习检测LTR_RTs的阴性实例。数据来源于InpactorDB及多个植物基因组数据库，涵盖编码序列、各类RNA及非LTR类转座元件，为相关模型训练提供负样本支持。 文件详解 文件名称：negative_instances_raw.zip...
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  • TNL_Genes_Peach_Based抗病基因家族结构与PL域研究数据

    2026年1月21日 30 72 4

    数据集概述 本数据集围绕桃（Prunus persica）中的TIR-NB-LRR（TNL）基因家族展开，重点分析其C端后LRR（PL）结构域的特征。包含桃基因组中TNL基因的预测、PL域的序列比对、系统发育树构建等相关数据，共6个文件，支持植物抗病基因功能及结构域进化研究。 文件详解 文件名称：PJ2 predictions Fgenesh.zip...
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  • Mitogenomic_Based_长须鲸亚种线粒体基因组系统发育研究数据

    2026年1月21日 30 155 112

    数据集概述 本数据集为长须鲸亚种线粒体基因组系统发育研究的支撑数据，包含154个长须鲸样本的完整线粒体基因组（约16K碱基对）分析结果，涉及北太平洋、北大西洋（含地中海）及南半球的样本。数据通过贝叶斯树等方法揭示了不同海域长须鲸的系统发育关系，为修订长须鲸亚种分类提供遗传证据。数据集共包含9个文件。 文件详解 样本信息文件 文件名称：Bphy...
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  • C_bovis_Genome_Source_牛隐杆线虫基因组与进化分析数据

    2026年1月21日 30 132 87

    数据集概述 本数据集为论文“The genome of C. bovis”的核心数据文件，包含牛隐杆线虫（C....
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  • Sadier_et_al_Based_新热带蝙蝠视蛋白损失多因素进化研究数据

    2026年1月20日 30 65 29

    数据集概述 本数据集围绕新热带蝙蝠视蛋白损失的多因素进化过程展开，包含视蛋白基因序列、转录本及蛋白质相关数据，用于研究蝙蝠视觉表型损失中的转录与转录后调控机制，揭示基因型与表型的复杂关系，共含5个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：README_for_Sadier_et_al_Opsins.txt 文件格式：TXT...
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  • Patiria_miniata_Based_海星卵精子结合素受体结构进化研究数据

    2026年1月19日 30 12 4

    数据集概述 本数据集为海星Patiria miniata卵表面精子结合素受体（EBR1）的结构与进化研究相关数据，包含6个雌性个体卵巢转录组的组装结果及说明文档，用于分析该受体的编码序列、蛋白结构域及种群间选择模式，揭示精卵识别分子的共进化机制。 文件详解...
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  • RH89_039_16_Based_二倍体马铃薯单倍型解析基因组数据_科研数据集

    2026年1月15日 30 112 59

    数据集概述 本数据集为二倍体马铃薯RH89-039-16的单倍型解析基因组组装与注释数据，包含1.67 Gb的基因组序列、基因模型及功能注释信息。通过多测序策略解析其高度杂合基因组，揭示了约2.1%的基因组内多样性，涉及有害突变及等位基因表达与甲基化差异，为马铃薯从四倍体无性繁殖向二倍体杂交育种转型提供基因组学基础。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Ceratodon_purpureus_De_novo_转录组组装与比较分析数据

    2026年1月15日 30 134 18

    数据集概述 本数据集包含紫萼藓（Ceratodon purpureus）雌雄分离株的转录组从头组装与比较分析数据，使用454 FLX技术生成。通过与小立碗藓（Physcomitrella patens）的比较分析，覆盖了原丝体转录组，为研究苔藓植物基因家族进化、生理发育分化及密码子使用偏好提供资源，共含12个文件。 文件详解 预测序列文件...
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  • Parasitic_plants_Based_寄生植物三基因组分子进化速率研究数据

    2026年1月15日 30 148 42

    数据集概述 本数据集为寄生植物分子进化速率研究的补充数据，包含12个被子植物寄生生活方式独立起源类群的线粒体、核和叶绿体三基因组DNA序列分析结果，验证寄生植物分子进化速率普遍高于非寄生亲缘类群的结论，支持相关进化机制探讨。 文件详解 README_for_Comparisons.txt 文件格式：TXT...
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  • Immune_Genes_Based两种野生啮齿动物免疫基因编码序列与表达差异分析数据

    2026年1月14日 30 16 9

    数据集概述 本数据集围绕两种野生啮齿动物（黄颈鼠与 bank voles）的脾脏转录组展开，分析不同功能类别的免疫基因在编码序列和表达上的种间差异，涉及模式识别受体、信号转导蛋白、转录因子等四类免疫基因，探讨序列与表达差异的关联性及对免疫功能的影响。 文件详解 数据文件...
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  • Faster_X_Effects_Based_果蝇X染色体与常染色体进化速率比较研究数据

    2026年1月13日 30 66 26

    数据集概述 本数据集为研究果蝇X染色体快速进化效应的相关数据，包含黑腹果蝇和拟暗果蝇两个类群的全基因组编码序列进化率分析结果，涉及X染色体与常染色体基因座的适应性替换差异，以及拟暗果蝇类群中祖先X染色体与常染色体融合事件对基因进化的影响，共含一个文件。 文件详解 文件名称：Alignments.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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  • Antarctic_endolithic_Based_南极石内细菌宏基因组组装基因组数据

    2026年1月13日 30 168 141

    数据集概述 本数据集包含2015-16年意大利南极考察采集的南极隐生石内群落细菌宏基因组组装基因组（MAGs）及注释数据，涵盖高质量/中等质量MAGs、元数据、编码序列、功能注释、代表性基因组、序列比对及样本信息等8个文件，用于南极极端环境微生物研究。 文件详解 MAGs.zip 文件格式：ZIP...
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  • De_novo_Adaptive_Immune_System_小鼠新生基因免疫耐受进化研究数据

    2026年1月12日 30 55 54

    数据集概述 本数据集为研究脊椎动物适应性免疫系统与新生基因进化关系的配套数据表，基于小家鼠三个近缘自然种群幼鼠多组织转录组分析结果，包含新生基因转录的组织分布、免疫相关组织（胸腺、脾脏）的表达特征等核心数据，共4个文件。 文件详解 文件名称：Data Table 1 CDS list.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • ENA_PRJEB62664_Symphonia_globulifera全基因组组装与注释数据

    2026年1月12日 30 149 103

    数据集概述 本数据集包含热带雨林物种Symphonia globulifera的从头组装核基因组、叶绿体基因组及线粒体基因组相关数据，涉及基因组组装、注释、编码序列提取及基因比对结果，可用于研究该物种的种内遗传变异特性，共包含7个文件。 文件详解...
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  • Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018

    2026年1月12日 30 12 8

    数据集概述 本数据集为沙门氏菌（Salmonella enterica）的cgMLST方案，2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座，用于微生物基因组分型分析，数据集以压缩包形式提供。 文件详解...
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  • Howea_palms_sympatric_speciation_gene_expression_data

    2025年12月30日 30 203 64

    数据集概述 本数据集围绕豪勋爵岛两种同域分化的Howea棕榈展开，包含转录组统计、样本统计及转录组序列文件，旨在探究基因表达与编码序列进化在生态物种形成中的作用，关联土壤适应性、开花时间等关键生态表型差异。 文件详解 Table_S5 - Transcriptome stats.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Alternaria_alternata_bZIP_Based_链格孢菌转录因子胁迫响应与致病机制研究数据

    2025年12月30日 30 72 50

    数据集概述 本数据集围绕链格孢菌（Alternaria alternata）中bZIP转录因子展开，包含该真菌的基因组序列、基因注释及代谢通路分析文件，覆盖基因功能、KEGG通路、GO注释等信息，为研究其在胁迫响应与致病过程中的作用提供基础数据支撑。 文件详解 基因组序列文件...
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