数据集概述
本数据集围绕豪勋爵岛两种同域分化的Howea棕榈展开,包含转录组统计、样本统计及转录组序列文件,旨在探究基因表达与编码序列进化在生态物种形成中的作用,关联土壤适应性、开花时间等关键生态表型差异。
文件详解
- Table_S5 - Transcriptome stats.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含转录组相关统计信息(具体字段未提供预览,推测为组装完整性、基因数量等转录组测序基本指标)
- Table_S1 - Sample stats.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含样本相关统计信息(具体字段未提供预览,推测为样本采集信息、测序深度、质量控制指标等)
- Howea_forsteriana_Trinity_transcriptome.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Howea forsteriana的Trinity组装转录组序列文件,包含转录本的核苷酸序列信息
数据来源
论文“Ecological speciation in sympatric palms: 1. Gene expression, selection and pleiotropy”
适用场景
- 植物生态物种形成机制研究: 分析基因表达差异与编码序列进化在同域物种分化中的作用
- 棕榈适应性性状关联分析: 探究盐度、干旱、pH响应及开花时间相关基因的功能
- 转录组数据分析方法验证: 利用棕榈转录组统计数据测试转录组组装与注释流程
- 生态物种形成基因筛选: 基于表达与序列差异筛选潜在的生态物种形成关键基因
- 进化生物学假说验证: 支持或反驳多效性在基因流存在下物种形成中的作用假说