数据集概述
本数据集为南极稀有放线菌新属新种Barrientosiimonas humi gen. nov., sp. nov. 39T的全基因组测序与注释结果源文件，包含基因组特征、功能分类、蛋白序列相似性等分析内容，共10个文件，可用于该菌株的基因组学与功能生物学研究。
文件详解
- 功能分类分析文件（.xlsx格式，共6个）
- 包含：Fig. 3@Table S3 KEGG功能分类.xlsx、Fig. 2@Table S2 COG功能分类.xlsx、Fig. 1@Table S1 GO功能分类.xlsx等
- 内容：基于eggNOG-mapper的KEGG、COG、GO功能分类结果，涉及酶映射数量、25类COG分类等分析
- 蛋白序列分析文件（.xlsx格式，共3个）
- 包含：Fig. S2蛋白序列相似性.xlsx、Fig. S3蛋白序列相似性.xlsx、Fig. S4物种分布.xlsx
- 内容：BLASTX、Blast2GO及eggNOG-mapper的蛋白序列相似性分析，BLASTX的top-hit物种分布数据
- 基因组完整性评估文件（.xlsx格式，1个）
- 文件名：Fig. S1 BUSCO完整性评估.xlsx
- 内容：BUSCO对基因组组装、转录组及基因集（蛋白）的完整性评估结果
- 基因组特征文件（.docx格式，1个）
- 文件名：Table 1 Genome features of B. humi.docx
- 内容：记录B. humi的基因组特征信息
- 次生代谢物区域文件（.docx格式，1个）
- 文件名：Table 2 Secondary metabolites BGCs regions in B. humi.docx
- 内容：B. humi中次生代谢物生物合成基因簇（BGCs）区域信息
数据来源
欧洲核苷酸档案库（ENA），登录号PRJEB44986 / ERP129097
适用场景
- 微生物基因组特征分析: 基于基因组特征文件研究B. humi的基因组结构与基本特性
- 功能基因组学研究: 利用KEGG、COG、GO功能分类数据，分析该菌株的基因功能与代谢通路
- 蛋白组学分析: 通过蛋白序列相似性数据探究B. humi的蛋白功能与进化关系
- 物种进化研究: 基于top-hit物种分布数据，分析B. humi与其他物种的亲缘关系
- 次生代谢物研究: 利用BGCs区域数据挖掘该菌株的次生代谢物合成潜力
- 基因组组装质量评估: 通过BUSCO完整性评估结果验证基因组组装的可靠性
