找到16个数据集

标签: 功能基因组学

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  • 异关节类辐射演化中牙齿退化平行发生的基因组学研究补充材料2023

    2025年12月19日 30 98 14

    数据集概述 本数据集是2023年发表的异关节类（Xenarthra）牙齿退化平行发生基因组学研究的补充材料，包含支撑研究结论的脚本、序列数据集、补充表格和图表。核心内容围绕十一个牙齿相关基因的外显子捕获、序列比对、突变分析及演化模型结果展开，为验证异关节类牙齿退化的平行演化机制提供了完整的实验数据与分析资源。 文件详解...
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  • 表型_基因型密码子模型检测适应性进化数据集

    2025年12月18日 0 148 4

    数据集概述 该数据集包含与表型-基因型密码子模型（PG-BSM）相关的研究数据，PG-BSM用于检测与离散表型进化相关的适应性密码子进化证据。数据集提供了研究中使用的真实比对数据、模拟数据及补充材料，支持对分子适应性进化机制的分析。 文件详解 文件名称：sysbio_paper_real_alignments.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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  • TERRA_REF植物表型组学与基因组学参考数据集

    2025年12月18日 30 7 5

    数据集概述 该数据集是由ARPA-E资助的TERRA-REF项目生成的开放参考数据集，聚焦植物传感、基因组学与表型组学研究。包含田间扫描平台获取的多传感器数据（如彩色、热成像、高光谱等）及传统田间测量数据，用于支持表型提取算法的校准与验证，覆盖高粱和硬粒小麦的多样性面板及育种群体。 文件详解 该数据集包含6个文件，具体说明如下： -...
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  • 真菌植物病原体Starship巨型转座子与毒力进化数据集

    2025年12月12日 30 48 41

    数据集概述 本数据集围绕真菌植物病原体中Starship巨型转座子展开，包含其在大丽轮枝菌基因组中的分布、功能注释及水平转移证据，为研究转座子驱动的真菌毒力进化提供数据支持。 文件详解 文件名称: File description.xlsx 文件格式: Excel表格（.xlsx） 内容说明: 可能包含数据集所有文件的详细描述与用途说明 文件名称:...
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  • 拟南芥自然种群中短串联重复序列长度变异与基因表达关联数据集

    2025年12月12日 30 32 6

    数据集概述 本数据集围绕拟南芥自然种群展开，探究短串联重复序列（STRs）长度变异与基因表达的关联。通过转录组数据建模分析STR长度对基因表达的影响，并结合实验验证，为理解植物基因表达调控及适应性进化提供数据支持。 文件详解 分析结果与模型文件： GeneExp.Figures.html：HTML格式，展示基因表达相关图表...
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  • 甘薯转录组EST_SSR摘要表3

    2025年12月11日 30 69 24

    数据集概述 该数据集为研究论文中的表格数据，呈现甘薯转录组中表达序列标签-简单重复序列（EST-SSRs）的统计摘要，包括检测序列数量、SSR总数、不同核苷酸重复类型分布等核心指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: 包含甘薯转录组EST-...
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  • 杂交区差异渐渗与候选屏障基因数据集

    2025年12月10日 30 42 12

    数据集概述 本数据集围绕杂交区作为“基因组筛”的作用，分析控制拟声蟋蟀（G. pennsylvanicus与G. firmus）种间基因交流的候选屏障基因。通过精囊腺转录组扫描与125个SNP标记，对比精液蛋白基因与同组织非精液蛋白基因的渐渗模式，识别出可能参与生殖隔离的关键基因。 文件详解 文件名称: README_for_Figure...
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  • 盔形溞捕食者诱导响应的遗传基础研究数据集

    2025年12月10日 30 54 30

    数据集概述 本数据集围绕盔形溞（Daphnia galeata）对鱼类信息素诱导的捕食者响应展开，包含差异基因表达分析、基因共表达网络分析及直系同源分析结果，涉及125个候选转录本，为探究其捕食者诱导响应的分子机制与进化保守性提供数据支持。 文件详解 说明文档： Readme_Tams2020EcolEvol.txt：文本格式，数据集整体说明文档...
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  • 水稻基因组组装数据集

    2025年12月9日 30 136 23

    数据集概述 该数据集包含三种水稻（IR64、Komboka、Ciherang Sub-1）的基因组组装数据，基于Oxford Nanopore测序读段生成假分子序列，并提供通过AUGUSTUS 3.5获得的结构基因注释，为水稻基因组研究提供基础数据。 文件详解...
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  • ceRNAxis_ceRNA_ref_Based_ceRNA网络参考分析完整数据

    2025年12月8日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含ceRNAxis流程使用的完整参考ceRNA网络数据，涉及不同物种中miRNA与ceRNA（mRNA、lncRNA等）的相互作用关系，数据来源于RNAInter数据库，为ceRNA机制研究提供基础参考网络。 文件详解 文件名称: ceRNA_ref.csv 文件格式: CSV 字段映射: miRNA: miRNA名称...
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  • 噬菌体基因必要性高通量表征数据集

    2025年12月7日 30 42 10

    数据集概述 本数据集是论文"Systematic, high-throughput characterization of bacteriophage gene essentiality on diverse hosts"的配套数据，包含噬菌体基因必要性的高通量表征数据，以压缩文件形式存储，按噬菌体类型（T7、T4、Bas63）分类整理。 文件详解...
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  • NetworkSSC单细胞数据网络引导稀疏子空间聚类数据集

    2025年12月5日 30 20 17

    数据集概述 该数据集围绕单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的聚类分析展开，包含NetworkSSC方法相关的文件。NetworkSSC是一种整合基因网络拉普拉斯矩阵的稀疏子空间聚类方法，用于提升细胞类型识别的准确性，为单细胞数据分析提供支持。 文件详解 文件名称：data.zip 文件格式：ZIP（.zip）...
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  • 果蝇表皮生长因子受体基因座核苷酸变异数据集

    2025年12月5日 30 207 66

    数据集概述 本数据集聚焦果蝇表皮生长因子受体（Egfr）基因座的核苷酸变异，涵盖三个种群250个等位基因的编码区及调控区序列分析，包含SNP、插入缺失多态性等遗传变异数据，为研究该基因座的群体遗传结构提供支持。 文件详解 该数据集包含11个文件，具体说明如下： -...
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  • 两种携带军团菌共生体的未培养耐格里属物种比较单细胞基因组学数据集

    2025年12月5日 30 126 105

    数据集概述 本数据集为比较单细胞基因组学研究的补充材料，包含两种携带军团菌共生体的未培养耐格里属新物种及相关异叶足纲物种的基因组组装、基因集与功能注释数据，支持对其共生关系及基因组特征的分析。 文件详解 文件名称: Data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...
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  • 鲸偶蹄目上皮钠通道δ亚基进化路径与钠感知作用研究源数据

    2025年12月5日 30 30 17

    数据集概述 本数据集为研究论文《鲸偶蹄目上皮钠通道δ亚基进化路径与钠感知作用》的全部源数据，包含七个压缩文件，每个文件内附详细说明文档，支撑该研究的进化分析与功能探索。 文件详解 压缩文件组：共7个ZIP格式文件，分别为Source-Data-1.zip至Source-Data-7.zip，每个文件内包含对应研究模块的源数据及说明文档（Read Me）...
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  • 人类衰老基因组资源数据集

    2025年4月15日 30 206 181

    人类衰老基因组资源数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：人类衰老,基因组学,功能基因组学,网络分析,系统生物学,进化分析,生物信息学 数据概述：...
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