数据集概述
本数据集包含ceRNAxis流程使用的完整参考ceRNA网络数据,涉及不同物种中miRNA与ceRNA(mRNA、lncRNA等)的相互作用关系,数据来源于RNAInter数据库,为ceRNA机制研究提供基础参考网络。
文件详解
- 文件名称: ceRNA_ref.csv
- 文件格式: CSV
- 字段映射:
- miRNA: miRNA名称
- ceRNA: ceRNA名称
- species: 物种(如Homo sapiens)
- database: 数据来源数据库(如RNAInter)
- type: 相互作用类型(如miRNA-mRNA、miRNA-lncRNA)
- 文件名称: demo.zip
- 文件格式: ZIP
- 内容说明: 压缩包文件,可能包含示例数据或相关资源
数据来源
ceRNAxis(https://github.com/thelingxichen/ceRNAxis)
适用场景
- ceRNA机制研究: 分析miRNA与mRNA、lncRNA等ceRNA的相互作用网络
- 基因调控网络分析: 构建或验证特定物种的ceRNA调控关系
- 生物信息学工具开发: 为ceRNA相关分析流程提供参考网络数据支持
- 功能基因组学研究: 探索非编码RNA在基因表达调控中的作用