微生物基因组分型工具框架camlhmp代码与数据

数据集概述

本数据集包含论文《camlhmp: A simple framework for building reproducible microbial genome-based typing tools》的配套代码与数据，涵盖基因组组装下载分析代码、Bactopia结果、元数据及绘图用R代码，为微生物分型工具开发提供可复现资源。

文件详解

• 文件名称：camlhmp.zip
• 文件格式：ZIP压缩包（.zip）
• 压缩包内容：包含论文相关的所有代码与数据，具体涉及：
• 基因组组装下载与分析代码
• Bactopia分析结果数据
• 元数据下载文件
• 绘图用R代码文件

适用场景

• 微生物基因组分型工具开发：基于框架构建可复现的微生物分型分析流程
• 基因组数据分析研究：利用代码复现论文中的基因组组装下载与分析步骤
• 生物信息学方法验证：验证Bactopia工具在微生物分型中的应用效果
• 科研绘图方法参考：学习使用R代码生成微生物基因组分析相关图表