数据集概述
本数据集围绕东北太平洋石鱼(Sebastes diaconus)的种内变异展开,包含其基因组变异与耳石形态数据。研究覆盖俄勒冈海岸近岸与离岸共3个采样点,分析了15000余个中性基因座的遗传差异及耳石形态的性二态性,为理解该物种种群结构及管理提供基础数据。
文件详解
- 基因组数据文件
- VCF格式文件(5个):包括deacon-three-sites.vcf、deacon-sex-all.vcf等,记录不同分组(近岸-离岸、性别相关、异常基因座)的基因组变异信息
- GENEPOP格式文件(3个):如deacon-near-off.genepop.txt,为种群遗传学分析格式,包含样本基因型数据
- FASTA格式文件(1个):deacon-sex-outlier.loci.fa,记录性别相关异常基因座的序列信息
- 形态与统计数据文件
- Excel文件(2个):deacon-otoliths1.xlsx记录耳石形态测量数据,deacon-genetics1.xlsx包含遗传学分析统计结果
数据来源
论文“Sex matters: Otolith shape and genomic variation in deacon rockfish (Sebastes diaconus)”
适用场景
- 海洋鱼类种群遗传学研究:分析石鱼近岸与离岸种群的遗传结构及基因流模式
- 性二态性机制研究:通过性别相关异常基因座探索石鱼性别分化的遗传基础
- 耳石形态分析:利用耳石形态数据研究石鱼的二次性征差异及年龄相关影响
- 渔业资源管理:为石鱼种群划分及资源评估提供遗传学与形态学依据