数据集概述
本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。
文件详解
- 基因序列文件
- 文件名称:uce-5186.fasta、habroRADs_minsamp4.phy等
- 文件格式:.fasta(260个)、.phy(4个)、.phylip(1个)
- 字段映射介绍:包含超保守元件(UCEs)序列、RADseq序列比对数据,用于系统发育与群体遗传分析
- 辅助文件
- 文件名称:sample_information.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:记录样本基本信息,支持实验设计与数据关联
- 说明文件
- 文件名称:README.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:提供数据集背景、文件说明及使用指引
数据来源
论文“Evolutionary impacts of introgressive hybridization in a rapidly evolving group of jumping spiders (F. Salticidae, Habronattus americanus group)”
适用场景
- 物种形成机制研究: 分析渐渗杂交对Habronattus americanus物种复合体分化的影响
- 基因组进化分析: 利用RADseq与UCEs数据探究网状进化历史与基因流模式
- 形态与遗传关联研究: 结合形态聚类与遗传谱系数据,解析选择压力对雄性形态的维持作用
- 进化模型验证: 对比传统分支进化模型与网状进化模型的适用性,支持生物进化理论研究
- 群体遗传学分析: 通过STRUCTURE、GEMMA等方法,解析地理区域对基因组相似性的影响